تفکیک ماسترویروس های کوتولگی گندم و جو با واکنش زنجیره ای پلیمراز

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 781

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI07_0681

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

ویروس کوتولگی گندم (WDV) و ویروس کوتولگی جو (BDV) از جنس Mastrevirus و تیره Geminiviridae از عوامل مهم بیماری های کوتولگی و زردی در گندم و جو می باشند BDV بطور طبیعی تنها از جو جدا شده است اما WDV علاوه بر گندم قادر به ایجاد بیماری در تعداد دیگری از غلات از جمله جو بوده است. تاکنون تفکیک این دو ویروس بر اساس تعیین ترادف ژنوم ویروس و مقایسه آن ها با اطلاعات موجود در بانک ژن صورت می گرفت. در این تحقیق از طریق همردیف سازی ترادف نوکلئوتیدی ژنوم این ویروس ها مشخص گردید انتهای 5 ژن Rep A در آن ها دارای اختلاف فاحشی می باشد به این صورت که تمام جدایه های WDV حاوی یک ترادف 12 نوکلئوتیدی در این ناحیه می باشند که در جدایه های BDV وجود ندارد. بر این اساس یک آغازگر 25 نوکلئوتیدی (AGCGAGWCDTTCATCAACTACTCG-3ا-5) که روی رشته مکمل ویروسی قرار داشته و حاوی این 12نوکلئوتید در انتهای 3 خود بود طراحی گردید. این آغازگر بسیار اختصاصی عمل نمود و همراه با آغازگرهای 'CTACGGCGTTTGATGTTGATAGTG-3ا-5 و CTACGGCGTTTGATGTTGATAGTG-3' ا-5' که روی رشته ویروسی قرار دارند تنها قادر به تکثیر قطعاتی از ژنوم WDV به اندازه های 600 و 300 جفت باز بود. در حالیکه آغازگر های طراحی شده از نواحی دیگر ژنوم اختصاصی عمل ننموده و قادر به تکثیر هر دو ویروس بودند. این روشبرای بررسی وقوع دو ماسترویروس در استان فارس استفاده شد، نتایج حاصله نشان داد که آلودگی نمونه های گندم و جو جمع آوری شده به BDV بیش تر از WDV می باشد. این روش به عنوان روشی سریع، دقیق و مقرون به صرفه در تفکیک این دو ویروس از هم معرفی می گردد

کلیدواژه ها:

ویروس های کوتولگی گندم وجو ، ماسترویروس ، واکنش زنجیره ای پلیمراز

نویسندگان

محمد هادی عمید مطلق

دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

سید علی اکبر بهجت نیا

عضو هیئت علمی مرکز تحقیقات ویرو سشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

علیرضا افشاریفر

عضو هیئت علمی مرکز تحقیقات ویرو سشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

کرامت اله ایزدپناه

عضو هیئت علمی مرکز تحقیقات ویرو سشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Behjatnia, S. A. _ Izadpanah, K. Dry, I. B., and ...
  • Kikli, G. & Ramsell, J. N. E., 2007. The complete ...
  • Missich, _ Rami rez-Parra, E. & Gutierrez, C., 2000. Relationship ...
  • _ _ _ _ _ _ _ A., 2008. Sequence ...
  • Wu, B., Mlcher, U., Guo, X., Wang, X, Fan, L ...
  • نمایش کامل مراجع