شناسایی بیوانفورماتیکی میکرو RNA ها در انگور

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 880

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

BSCONF01_659

تاریخ نمایه سازی: 15 بهمن 1393

چکیده مقاله:

میکرو RAN ها، RAN های غیرکدکننده به طول 24-19 نوکلئوتید هستند که نقش مهمی را در تنظیم ژن پس از ترجمه ایفا می کنند. ماهیت حفظ شده این مولکول ها، اساس شناسایی میکرو RNA های جدید را از طریق جستجوی همولوژی فراهم می کند. در مطالعه حاضر برای شناسایی میکروRNA های جدید، از میکرو RNA های گیاهی موجود در پایگاه داده miRBase جهت جستجوی همولوگهای احتمالی در ژنوم انگور استفاده شد. توالی های همولوگ با کمتر از 4 عدم تطابق برای پیش بینی ساختارهای ثانویه بررسی شدند و پس از رعایت مجموعه ای از ضوابط، تعداد 25 میکرو RNA حفظ شده متعلق به سه خانواده میکرو RNA شناسایی شد که بر تعداد میکرو RNA های ثبت شده برای انگور افزوده است.

نویسندگان

سهیلا فاطمی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی، گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه کردستان

بهمن بهرام نژاد

دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه کردستان

جلال رستم زاده

استادیار گروه علوم دامی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Akan, Das. Et al, Comp utational Identification of Conserved microRNAs ...
  • Bartel, D, P. MicroRNAs: Target recognition and regulato ry functions, ...
  • Bharati, Pandey. et al, Identification of new stress-induced microRNA and ...
  • Baohong, Zhang. et al, Conservation and divergence of plant microRNA ...
  • Dong, Q.H. et al, Computationa l Identification of MicroRNAs in ...
  • Griffiths-ones, S. et al, The microRNA Registry, Nucleic Acids Res, ...
  • Hyun-Jin, Kim. Et al, In silico identification and cha racterization ...
  • Iftekhar, A, B. et al, Bioinformatic Hunting of MicroRNAs, Pure ...
  • Na, Guo. et al, Comp utational identification of novel microRNAs ...
  • Onsaya, Patanun. et al, Computationa l Identification of MicroRNAs and ...
  • Sungrolh, Yoon. et al, Computationa l Identification of MicroRNAs and ...
  • Susanne, Rother. et al, Small RNAs derived from longer non ...
  • Yanping, zhang. et al, computational identification ofmicroRNAs in peach expressed ...
  • _ Yu, H, S. et al Compu tational identification of ...
  • Zhang, B, H. et al, Identification and cla racterization of ...
  • Zhang, B, H. et al, Evidence that mirnas are different ...
  • Zhang, B, X. et al, Identification of 188 Conserved Maize ...
  • Zhang Z, Yu. et al, PMRD: plant microRNA database, Nucleic ...
  • Zuker, M. Mfold Web Server for Nucleic Acid Folding and ...
  • نمایش کامل مراجع