سنجش همسانی ژن سیتوکرومP-450 بین انسان و شتر برای مقاومت به فشار خون و سموم محیطی
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 918
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_1269
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
چکیده مقاله:
ژنهای بسیاری در حیوانات مسئول مقاومت در برابر بیماریها هستند. اگرچه سیستم فیزیولوژیک و تکامل موجودات، مشابه هم نیست ولی عملکرد تمامی موجودات متأثر از ژنها است که محیط در بیان آنها دخالت دارد. در مقاله حاضر با توجه به استعداد پایین شتر درابتلاء به فشار خون و مقاومت بالا در برابر سموم و شرایط سخت محیطی، برخی ژنها از قبیل ژنهای خانواده سیتوکروم 450P که مسئول این ویژگیهای منحصر به فرد در شتر هستند با ژنها و توالی پروتئینهای انسان مقایسه شدند. توالی ژنومی از پایگاههای داده بیوتکنولوژی بدست آمد. از آنجاییکه اطلاعات ثبت شده برای اکثریت ژنهای شتر بهویژه انواع پروتئینهایCYPخانواده سیتوکروم (P450در پایگاههای داده موجود نبود، لذا از برخی توالی گونههای نزدیک به آن همانند شتر دوکوهانه وحشی و گاو استفاده شد. آنالیزبیوانفورماتیک توسط نرم افزارهای مجموعهBlastP و Mega ،Bio edit ،Laser geneانجام شد. نتایج هم ترازی چندگانه نشان داد اسیدهای آمینهPhe و Pro ،Thrدر تمامی ایزوفرمها کاملاً حفظ شده است. بیشترین فراوانی اسید آمینه برای توالی توافقی به اسیدهای آمینهPhe و Gly ،Proتعلق داشت. تغییر آمینو اسیدی در ایزوفرمهای یکسان بین شتر و انسان کاملاً مشهود بود که می توان ناشی از جهش دانست، مثلاً اسیدهای آمینهSer و Val ،Alaدر بخشی از ایزوفرمCYP2W1 انسان به ترتیب توسطThr و Leu ،Valدرشتر جایگزین شده است. نقطه ایزوالکتریک ایزوفرمهای شتر بیشترین9/6برای CYP2E1و در انسان کمترین8/1برای CYP2E1محاسبه شد. نتایج درخت تکامل بر اساس حداکثر درست نمایی نشان داد برخی ایزوفرمهای شتر با انسان در یک زیر خوشه جای داردCYP1A و 1 CYP2W1 ،CYP2C9 انسان به ترتیب با 92CYP1A و 1 CYP2W1 ،CYP2Cشتر). نتایج همسانی ژنومی و شاخصE-valueنشان داد بالاترین درصد همسانی ( 83 درصد) بهCYP2W1 بین شتر دوکوهانه وحشی و انسان تعلق داشت، در ضمن همسانی ژنومی بینCYP2E1شتر دوکوهانه وحشی با گاو ( 76 درصد) بیشتر از همسانی ژنومی بین CYP2E1 شتردوکوهانه وحشی با انسان ( 68 درصد) محاسبه شد. در ضمن ژنوم گاو ایزوفرمCYP2E1شتر را به طور کامل پوشش داد. در نهایت تحقیق حاضر تولید داروهای سنتتیک و تحریک جهشهای مؤثر بر اساس ساختار پلی پپتیدیCYPهای شتر را راهی ارزشمند در جهت بالابردن مقاومت انسانی به فشار خون و سموم محیطی می داند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
رضا طالبی
دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام دانشگاه بوعلی سینا همدان و ارائه دهنده مقاله
فضل اله افراز
هیئت علمی بخش ژنتیک و اصلاح نژاد موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، کرج، ایران
احمد احمدی
اعضای هیئت علمی دانشگاه بوعلی سینا همدان
سیدضیاءالدین میرحسینی
اعضای هیئت علمی دانشگاه گیلان.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :