تعیین ترادف ژن پروتئین پوششی جدایههای ویروس موزائیک گوجهفرنگی از استان ایلام و بررسی موقعیت فیلوژنتیکی آن
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 645
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_0379
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
چکیده مقاله:
ویروس موزائیک گوجهفرنگی Tomato mosaic virus-ToMV)از ویروسهای مهم بیمارگر در زراعت گوجهفرنگی میباشد. با توجه به اهمیت این زراعت در استان ایلام، در این بررسی تعداد 49 نمونه برگی با علائم موزائیک، پیسک و بدشکلی برگ از مزارع گوجهفرنگی استان فوق جمعآوری و از نظر آلودگی بهToMVبا استفاده از آنتیبادی اختصاصی به روش الایزا مورد آزمون قرار گرفتند. دو نمونه D2S و 2 Sh2S2با واکنش مثبت در آزمون الایزا انتخاب و با استفاده از واکنشRT-PCRو بکارگیری آغازگرهای اختصاصی، ناحیه ژن پروتئین پوششیCPویروسToMVتکثیر و تعیین توالی شد. طول توالی کامل نوکلئوتیدی ژنCP این دو جدایه480 نوکلئوتید بود که یک پروتئین فرضی بطول 159 اسیدآمینه تولید مینماید. توالیهای بدست آمده با توالیCP مربوط به 38 دیگر جدایهToMVثبت شده دربانک ژن، مورد مقایسه قرار گرفتند. در درخت تبارزایی رسم شده به روشNJسه تبار با تکرارپذیری بالامشاهده شد. تبارIIفقط شامل یک عضو از برزیل بوده در حالی که در تبار شمارهI,II جدایههای این ویروس از برزیل، ایران و نیز سایر نقاط دنیا قرار گرفتند. دوجدایه ایرانی مورد بررسی، در تبار شمارهIIIقرار گرفتند. در این تبار تعدادی دیگر از جدایههایToMVگزارش شده از ایران قرارداشتند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سعیده امیراولاد
گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام
رضا پوررحیم
بخش تحقیقات ویروسشناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، تهران
شیرین فرزادفر
بخش تحقیقات ویروسشناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، تهران
خشنود نوراللهی
گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام،
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :