تجزیه و تحلیل توالیهای غیرترجمه شونده اعضای خانواده عوامل رونویسی AP2/ERFدر گندم

تنشهای غیر زیستی سبب کاهش قابل توجه رشد و عملکرد گیاهان میشوند. خانواده AP2/ERFیک خانواده بزرگ از عواملرونویسی است که در پاسخ به تنشهای غیرزیستی نقش دارد. تنظیم بیان ژن در مرحله ترجمه براساسخصوصیات مولکولmRNAتعیین میشود که یکی ازمهمترین آنها نواحی غیرترجمه شوندهUTR هستند. در این مطالعه ویژگیهای نواحیUTR خانواده AP2/ERFدرگندم (شامل 136 عضو)، بر اساسروشهای بیوانفورماتیکی بررسی شد. بر اساس نتایج، میانگین طول ناحیهUTR-5 کمتر و محتوایGC آن بیشتر از ناحیهUTR-3 بود. موقعیت 4+ در % 60 از اعضا توسط گوانین و موقعیت 3 - نیز در بیشتر توالیها توسط نوکلئوتیدهای پورینی65/93درصداشغال شده بود. بیشترین تعداد کدون آغاز بالادستuATG 9 عدد) درTaAP2-1 بدست آمد. توالیUTR-5چهارژنTaAP2- و 14 TaAP2-9 ،TaAP2-2 ،TaERF-B4-9 دارای ناحیهای برای اتصال ریبوزوم، مستقل از کلاهک5IRES بودند. سه توالی هدف برای miRNAدر اعضا خانواده TaAP2ERFشناسایی شد که شامل یک توالی هدف درTaDREB-A6-1) 5´-UTRودوتوالی هدف درTaDREB-A1- و 17 TaDREB-A1-16) 3´-UTRبود. سه عنصر سیس LTRCOREATCORE15 20 جایگاه PROXBBNNAPAپنج جایگاه) وERELEE4 یک جایگاه) نیز به صورت اختصاصی فقط در توالی UTR-5′- اعضا این خانواده مشاهده شد.

کلیدواژه ها:

عامل رونویسی ، خانوادهAP2 ، ERF ، توالی غیرترجمه شونده ، گندم