تعیین ترکیب آلل های ناسازگاری / سازگاری در زردآلو (.Prunus armeniaca L) با استفاده از تجزیه و تحلیل ترادف توالی نوکلئوتیدی

موضوع خودناسازگاری در درختان میوه حائز اهمیت است. این صفت توسط حداقل دو ژن کاملاً شناخته شده با تنوع آللی گستردهکنترل می شود. در طی تحقیقی تعدادی از زردآلوهای اروپائی و ایرانی در کنار شاهد هائی با ترکیب آلل های معلوم، مورد آزمایشهای ملکولی قرار گرفتند تا وضعیت ژنوتیپ خودناسازگاری آن ها مشخص شود. بدین منظور دی ان ای ژنومی از نمونه های برگارقام مورد نظر به کمک روش های متعارف استخراج و مورد آزمایش های مبتنی بر پی سی آر با استفاده از آغازگرهای موثر، قرار گرفت. پس از تهیه الگوهای الکتروفورز بر روی ژل آگارز و مشخص شدن باند های مربوط به آلل های S واقع در جایگاه ژنی اس، اقدام به همسانه سازی آن ها و توالی یابی قطعات تکثیری گردید. به منظور اختصاص شماره های آلل های اس به نمونه های به دست آمده، به کمک نرم افزارهای برخط شامل CLUSTAL WWW و FASTA WWW، اقدام به بررسی ترادف توالی نوکلئوتیدهای به دست آمده با آنجه قبلاً در بانک های اطلاعاتی بین المللی از جمله NCBI, DDBJ و EBI ثبت شده بودند، گردید. تجزیه و تحلیل اطلاعات به دست آمده و تهیه دندروگرام ها، منتج به اختصاص آآلل های S به هر کدام از ارقام مورد مطالعه گردید. در این مقاله به نحوه تجزیه وتحلیل به کار رفته، اشاره شده است.

کلیدواژه ها:

زردآلو ، خودناسازگاری ، آلل S ، پی سی آر ، توالی یابی