ررسی ساختار سه بعدی آنزیم پرولین کربوکسیلات رداکتاز در گیاهان

بررسی ساختار سه بعدی و عوامل موثر بر آن میتواند درک بهتری از عملکرد پروتئینها را ارائه دهد. آنزیم پرولین کربوکسیلات رداکتاز مرحله نهایی سنتز پرولین را کاتالیز میکند. پرولین به عنوان یک اسمولایت مهم در تعدیل فشار اسمزی سلولهای تحت تنش های غیر زیستی نقش دارد. به منظور مطالعه این آنزیم، ساختار سه بعدی و توالی آمینواسیدی مربوط به این آنزیم برای گیاهان Zea Pisum sativum، mays, Arabidopsis thaliana, Glycin hispida از پایگاههای اطلاعاتی ExPASy و NCBI دریافت شد. با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی بررسیها بر روی ساختارهای ثانویه، محل ساختارهای ثانویه، نوع و مقدار اسیدهای آمینه، محل فسفوریلاسیون و محل اتصال لیگاند مشخص گردید. بررسیها نشان داد که پرولین بیشترین و تریپتوفان و تیروزین کمترین تعداد رادارند. مارپیچ آلفا حدود 50 % این آنزیم را تشکیل میدهد، همچنین مشخص شد که این آنزیم دارای دو دامنه است که یکی برای اتصال به NAD(P) و دیگری دامنه 6 -فسفوگلوکونات است. محل فسفوریله شدن نیز مشخص و با توجه به عملکرد یکسان این آنزیم در گیاهان مورد مطالعه نواحی حفاطت شده به طول 156 اسیدآمینه برای این آنزیم تعیین گردید که این نواحی نشان دهنده جایگاه فعال آنزیم میباشند. این عوامل بر روی ساختار سه بعدی و در نتیجه بر روی عملکرد این آنزیم موثر هستند.

کلیدواژه ها:

آنزیم پرولین کربوکسیلات رداکتاز ، پروتئین ، ساختار ثانویه ، ساختار سه بعدی