تنوع ژنوتیپی جدایه های Pectobacterium carotovorum عامل پوسیدگی نرم سیب زمینی از استان چهارمحال و بختیاری
محل انتشار: کنگره ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 630
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
IBRC01_186
تاریخ نمایه سازی: 5 مهر 1393
چکیده مقاله:
پوسیدگ یهای نرم سی بزمینی از جمله بیمار یهای مخرب این محصولدر بسیاری از مناطق کشت آن به شمار م یروند. باکتر یها بویژه اعضایجنس Pectobacterium از جمله مهمترین عوامل ایجاد بیماری درسی بزمینی هستند. که بواسطه داشتن آنزی مهای پکتولیتیک مختلفتوان تخریب ساختما نهای نگهدارنده )تیغه میانی( در باف تهای گیاهیو در نتیجه پوسیدگی نرم را دارند. طیف وسیع آنزی مهای پکتولیتیک وژ نهای کدکننده آنها همراه با سایر ژ نهای بیمار یزا، باعث گستردگیخسارت این باکتر یها شده است. از توالی ژ نهای کدکننده آنزی مهایپکتولیتیک م یتوان جهت شناسایی و تکفکیک گون هها و جمعی تهای اینباکتری استفاده کرد. به این منظور از حدود ١٥٠ نمونه با علائم پوسیدگینرم جم عآوری شده از مزارع مختلف سی بزمینی در استان چهارمحالو بختیاری، حدود ٥٠ جدایه باکتری بدست آمد که با آزمایشاتبیوشیمیایی، فیزیولوژیکی و بیمار یزایی ٣٠ جدایه Pectobacteriumcarotovorum تشخیص داده شدند. برای تأیید شناسایی از ژن پکتاتلیاز )ناحیه معروف به Pel ( اختصاصی گونه نیز استفاده شد. بدین ترتیبکه با استفاده از پرایمرهای اختصاصی Y1 و Y2 در واکنش زنجیر هایپلیمراز در تمامی جدای هها قطعه bp434 تکثیر گردید. برای مقایسهجدای ههای مختلف نیز از توالی همین قطعه تکثیر شده استفاده شد. بهاین منظور، محصول PCR تکثیر شده، با ٥ آنزی م برشی ) ، HaeII، HpaIIAluI، Sau3AI و HhaI ( به مدت ٤ ساعت هضم گردید و محصولحاصل با الکتروفورز روی ژل آگارز ٥/ ١% تفکیک شد. آنالیز الگوهای برشایجاد شده بوسیله نر مافزار Ntsys-Pc 2.0 انجام شد و جدای ههای موردبررسی را در 5 گروه تفکیک کرد. این گرو هبندی نشا ندهنده تنوع زیادجمعی تهای این گونه در استان می باشد که باید جهت برنام هریزی برایمدیریت بیمار یهای ناشی از این باکتر یها مورد توجه قرار گیرد
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سیده فاطمه هاشمی
دانشگاه شهرکرد دانشکده کشاورزی
علی اکبر فدائی تهرانی
دانشگاه شهرکرد دانشکده کشاورزی