سازی و بررسی ساختار پروتئین مرتبط با پاتوژن (PRپروتئین ها) در گیاه Hordeum vulgare L.

پروتئین های مرتبط با پاتوژن (PRپروتئین ها) گروهی از مهمترین پروتئین هایی هستند که در گیاه در مواجه با پاتوژن ها القاء می شوند. در این تحقیق ساختار های اولیه و ثانویه این انتی پورتر مورد ارزیابی قرار گرفت و مشخص گردید که قسمت اعظم این آنتی پورتر بصورت هیدروفیل می باشد و ساختار ثانویه الفا هلیکس ساختار غالب در این پروتئین می باشد همچنین ساختار سه بعدی این پروتئین نیز با استفاده از نرم افزار مدلر ساخته شد و به منظور پالایش ساختار سه بعدی، تحت کاهش انرژی قرار گرفت. مدل ساخته شده همچنین به منظور ارزیابی کیفیت مدل با استفاده از نمودار راماچاندران و الگوریتم QMEAN مورد ارزیابی قرار گرفت نتایج حاکی از کیفیت بالای مدل ساخته شده بود.

کلیدواژه ها:

پروتئین های مرتبط با پاتوژن ، جو ، ساختار سه بعدی.