تجزیه و تحلیل عناصر تنظیمی سیس مرتبط با تنش های غیرزیستی در پروموتر ژن های ANlNAC گیاه آلوروپوس لیتورالیس

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 25

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJBIO-35-3_014

تاریخ نمایه سازی: 11 آبان 1405

چکیده مقاله:

پروتئین های NAC (NAM، ATAF۱-۲ و CUC۲)، فاکتورهای رونویسی مختص گیاهان هستند و در فرآیند مختلف نمو گیاهان و پاسخ به تنش ها نقش دارند. در این مطالعه، ۶۸ ژن NAC در گیاه Aeluropus littoralis به عنوان گیاه هالوفیت متعلق به خانواده Poaceae شناسایی شدند. با تجزیه و تحلیل عناصر تنظیمی سیس در نواحی پروموتر ژن های AlNAC، بسیاری از عناصر مرتبط با رشد و نمو، فیتوهورمون ها و دفاع در برابر تنش ها یافت شدند. از جمله عناصر پاسخگو به هورمون ها می توان به P-box، TCA element، موتیف های CGTCA و TGACG، TGA-element، ERE و ABRE اشاره نمود که به ترتیب در پاسخگویی به جیبرلیک اسید، سالیسیلیک اسید، جاسمونیک اسید، اکسین، اتیلن و آبسیزیک اسید نقش دارند. برای عناصر پاسخگو به تنش می توان TC-rich repeats، ARE، MBS، LTR و W box را ذکر نمود که به ترتیب مرتبط با دفاع و تنش، القای بی هوازی، القای خشکی، القای دمای پایین و تنش آسیب های مکانیکی می باشند. انواع مختلف عناصر تنظیمی سیس در پروموتر ژن های AlNAC و تنوع در فاکتورهای رونویسی که به این عناصر متصل می شوند، حاکی از نقش مهم این ژن ها در نمو گیاه و دفاع در برابر تنش ها می باشند. با تجزیه و تحلیل بیان ژن کاندید AlNAC۳۲ با استفاده از RT-qPCR مشخص شد که این ژن تحت تنش های شوری، خشکی و ABA، در بافت های برگ، ساقه و ریشه، افزایش بیان نشان می دهد که بیانگر نقش این ژن در تحمل به چندین تنش غیرزیستی می باشد. این یافته ها اطلاعات ارزشمندی جهت تحقیقات بیشتر در مورد عملکرد و کاربرد ژن های AlNAC در رشد و سازگاری به تنش در A. littoralis فراهم آورده است.

نویسندگان

سمیرا محمدی

دانشجوی دکتری اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

قربانعلی نعمت زاده

استاد گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

حمید نجفی زرینی

دانشیار گروه بیوتکنولوژی و به نژادی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

سیدحمیدرضا هاشمی پطرودی

استادیار گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • تجزیه پروتئوم بذر کلزا تحت تنش شوری [مقاله ژورنالی]
  • جوانه زنی، فتوسنتز و رشد دو گونه هالوفیت پوکسنلیا دیستانس و آلوروپوس لیتورالیس تحت شرایط شوری و همزیستی آن ها با قارچ های میکوریز آربوسکول دار در شرایط طبیعی زیستگاه در دشت تبریز [مقاله ژورنالی]
  • هاشمی پطرودی، ح.ر و س. محمدی. ۲۰۲۰. شناسایی خانواده ژنی ...
  • هاشمی پطرودی، ح.ر.، ق.ع. نعمت زاده، س. محمدی و م. ...
  • An, J.P., X.F. Wang, X.W. Zhang, H.F. Xu, S.Q. Bi, ...
  • An, J.P., J.F. Yao, R.R. Xu, C.X. You, X.F. Wang ...
  • Azim, J.B., M.F.H. Khan, L. Hassan and A.H.K. Robin. ۲۰۲۰. ...
  • Bailey, T.L., M. Boden, F.A. Buske, M. Frith, C.E. Grant, ...
  • Chen, X., Y. Wang, B. Lv, J. Li, L. Luo, ...
  • Chow, C.N., H.Q. Zheng, N.Y. Wu, C.H. Chien, H.D. Huang, ...
  • Creelman, R.A., M.L. Tierney and J.E. Mullet. ۱۹۹۲. Jasmonic acid/methyl ...
  • Faraji, S., H. Najafi-Zarrini, S. Hashemi-Petroudi and G. Ranjbar. ۲۰۱۷. ...
  • Finn, R.D., P. Coggill, R.Y. Eberhardt, S.R. Eddy, J. Mistry, ...
  • Guo, Y. and S. Gan. ۲۰۰۶. AtNAP, a NAC family ...
  • Hall, T.A. ۱۹۹۹. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor ...
  • Hashemi-Petroudi, S.H., G.A. Nematzadeh, H. Askari and S. ۲۰۱۴. Involvement ...
  • Hashemi-Petroudi, S.H., G.A. Nematzadeh, H. Askari and Y. Ghasemi. ۲۰۱۲. ...
  • Hashemi, S.H., G. Nematzadeh, G. Ahmadian, A. Yamchi and M. ...
  • Hu, H., M. Dai, J. Yao, B. Xiao, X. Li, ...
  • Hu, R., G. Qi, Y. Kong, D. Kong, Q. Gao ...
  • Hu, W., Y. Wei, Z. Xia, Y. Yan, X. Hou, ...
  • Jones, P., D. Binns, H.-Y. Chang, M. Fraser, W. Li, ...
  • Khedia, , P. Agarwal and P.K. Agarwal. ۲۰۱۸. AlNAC۴ transcription ...
  • Kiełbowicz-Matuk, A. ۲۰۱۲. Involvement of plant C۲H۲-type zinc finger transcription ...
  • Ko, J.H., S.H. Yang, A.H. Park, O. Lerouxel and K.H. ...
  • Le, D.T., R. Nishiyama, Y. Watanabe, K. Mochida, K. Yamaguchi-Shinozaki, ...
  • Le Hir, R. and C. Bellini. ۲۰۱۳. The plant-specific dof ...
  • Lescot, M., P. Déhais, G. Thijs, K. Marchal, Y. Moreau, ...
  • Letunic, I., T. Doerks and P. Bork. ۲۰۱۴. SMART: recent ...
  • Liu, X., S. Liu, J. Wu, B. Zhang, X. Li, ...
  • Majda, M. and S. Robert. ۲۰۱۸. The role of auxin ...
  • Mittler, R. and E. Blumwald. ۲۰۱۵. The roles of ROS ...
  • Mou, S., Z. Liu, D. Guan, A. Qiu, Y. Lai ...
  • Nakashima, K., L.S.P. Tran, D. Van Nguyen, M. Fujita, K. ...
  • Nishiuchi, T., H. Shinshi and K. Suzuki. ۲۰۰۴. Rapid and ...
  • Nuruzzaman, M., R. Manimekalai, A.M. Sharoni, K. Satoh, H. Kondoh, ...
  • Ohnishi, T., S. Sugahara, T. Yamada, K. Kikuchi, Y. Yoshiba, ...
  • Olsen, A.N., H.A. Ernst, L.L. Leggio and K. Skriver. ۲۰۰۵. ...
  • Puranik, S., P.P. Sahu, S.N. Mandal, S.K. Parida and M. ...
  • Sablowski, R.W. and E.M. Meyerowitz. ۱۹۹۸. A homolog of NO ...
  • Sazegari, S., A. Niazi and F.S. Ahmadi. ۲۰۱۵. A study ...
  • Shinozaki, K. and K. Yamaguchi-Shinozaki. ۲۰۰۰. Molecular responses to dehydration ...
  • Souer, E., A. van Houwelingen, D. Kloos, J. Mol and ...
  • Sperotto, R., F.K. Ricachenevsky, G.L. Duarte, T. Boff, K.L. Lopes, ...
  • Stender, E.G., C. O'Shea and K. Skriver. ۲۰۱۵. Subgroup-specific intrinsic ...
  • Takasaki, H., K. Maruyama, S. Kidokoro, Y. Ito, Y. Fujita, ...
  • Tran, L.-S.P., K. Nakashima, Y. Sakuma, S.D. Simpson, Y. Fujita, ...
  • Trishla, V.S., S. Marriboina, P. Boyidi and P.B. Kirti. ۲۰۲۰. ...
  • Wang, L., Z. Hu, M. Zhu, Z. Zhu, J. Hu, ...
  • Wang, L., C. Wang, D. Wang and Y. Wang. ۲۰۱۴. ...
  • Wu, A., P. Hao, H. Wei, H. Sun, S. Cheng, ...
  • Xia, N., G. Zhang, X.Y. Liu, L. Deng, G.L. Cai, ...
  • Yamaguchi-Shinozaki, K. and K. Shinozaki. ۱۹۹۴. A novel cis-acting element ...
  • Yin, Y., L. Chen and R. Beachy. ۱۹۹۷. Promoter elements ...
  • Yu, T.F., W.Y. Zhao, J.D. Fu, Y.W. Liu, M. Chen, ...
  • Yue, Y., L. Li, Y. Li, H. Li, W. Ding, ...
  • Zhan, P.L., S.W. Ke, P.Y. Zhang, C.C. Zhou, B.L. Fu, ...
  • Zouari, N., R.B. Saad, T. Legavre, J. Azaza, X. Sabau, ...
  • نمایش کامل مراجع