تحلیل دینامیک مولکولی برهمکنش ۶ جینجرول با گیرنده فاکتور رشد فیبروبلاست ۲ به عنوان هدف کلیدی مسیر رگزایی در سرطان معده

سرطان معده (GC) از شایع ترین بدخیمی های دستگاه گوارش است و گیرنده فاکتور رشد فیبروبلاستی ۲ (FGFR۲) به عنوان یکی از اهداف کلیدی مسیر رگزایی نقش مهمی در پیشرفت این بیماری دارد. ۶ جینجرول، مهم ترین ترکیب زیست فعال زنجبیل به دلیل خواص ضدسرطانی گزینهای امیدوارکننده برای مهار این مسیر محسوب می شود. در این مطالعه، پایداری کمپلکس GRL/FGFR۲ با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی به مدت ۲۵۰ نانوثانیه و با تحلیل شاخص های RMSF، RMSD، پیوندهای هیدروژنی، Rg، فاصله، Protein Ligand، تعداد تماس ها، SASA و PCA بررسی شد. نتایج نشان داد کمپلکس GRL/FGFR۲ در طول شبیه سازی از پایداری ساختاری و دینامیکی مطلوبی برخوردار بوده، به طوری که نوسانات پارامترهای ساختاری محدود، فاصله لیگاند پایدار و برهمکنش های موثر حفظ شدند. همچنین تحلیل PCA وجود دو حالت کانفورماسیونی پایدار را نشان داد. این یافته ها بیانگر تمایل مناسب ۶ جینجرول به اتصال پایدار با FGFR۲ بوده و ظرفیت بالقوه آن را برای طراحی مشتقات جدید و توسعه درمان های هدفمند سرطان معده نشان می دهد.

کلیدواژه ها:

۶ جینجرول ، سرطان معده ، FGFR۲ ، رگزایی ، شبیه سازی دینامیک مولکولی