بهینه سازی یک زیست حسگر microRNA برای شناسایی بیماری لکه قهوه ای گیاه جو" >بهینه سازی یک زیست حسگر microRNA برای شناسایی بیماری لکه قهوه ای گیاه جو" >بهینه سازی یک زیست حسگر microRNA برای شناسایی بیماری لکه قهوه ای گیاه جو" >

<span lang="FA">بهینه سازی یک زیست حسگر <span dir="LTR">microRNA<span lang="FA"> برای شناسایی بیماری لکه قهوه ای گیاه جو

سال انتشار: 1405
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 20

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJBSE-57-3_003

تاریخ نمایه سازی: 18 مهر 1405

چکیده مقاله:

اگرچه ترکیبات microRNA از تنظیم کننده های کلیدی پاسخ گیاهان به تنش های زیستی به شمار می آیند، اما اندازه گیری دقیق آن ها به دلیل غلظت بسیار پایین، چالش برانگیز است. هدف از این پژوهش، توسعه و بهینه سازی یک زیست حسگر الکتروشیمیایی مبتنی بر microRNA و ارزیابی کارایی آن در شناسایی تنش زیستی ناشی از بیماری لکه قهوه ای در گیاه جو بود. بدین منظور، یک زیست حسگر الکتروشیمیایی بر پایه هیبریداسیون microRNA هدف با پراب الیگونوکلئوتیدی تثبیت شده بر سطح الکترود طلا و جذب نانوذرات نقره–پلی اتیلن ایمین با بار مثبت طراحی شد. برای بهینه سازی حجم پراب و جرم نانوذرات، از رگرسیون ماشین بردار پشتیبان استفاده شد. داده های آزمایشی شامل ۱۰۰ مشاهده بوده و اعتبارسنجی متقابل پنج تایی برای ارزیابی عملکرد مدل به کار رفت. پس از حصول اطمینان از عملکرد مطلوب مدل در پیش بینی پاسخ الکتروشیمیایی زیست حسگر (میانگین مربعات خطا ۰۰۴/۰ و ضریب تبیین ۹۷/۰)، مقادیر بهینه حجم پراب و جرم نانوذرات به ترتیب ۱۵/۹ میلی لیتر و ۸۵/۱ میکروگرم توسط مدل توسعه یافته تعیین شد. نمودار واسنجی زیست حسگر بهینه شده نشان دهنده محدوده خطی ۱۹-۱۰ تا ۱۱-۱۰ مولار بود و از زیست حسگر به دست آمده برای اندازه گیری غلظت ترکیبات miRNA۱۶۸ و miRNA۳۹۷ که نقش اساسی در پاسخ گیاه در برابر بیماری قارچی لکه قهوه ای دارند، بهره گرفته شد. داده های زیست حسگر حاکی از اختلاف قابل توجه غلظت این ترکیبات بین گیاه سالم و گیاه آلوده بودند که عملکرد آن را به عنوان یک روش مناسب برای شناسایی ظهور بیماری اثبات کرد. نتایج این پژوهش بیانگر پتانسیل قابل توجه زیست حسگر پیشنهادی برای شناسایی دقیق تنش های زیستی در گیاهان است.

نویسندگان

نوشین درخشان

گروه گیاه پزشکی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران

کامران رهنما

گروه گیاه پزشکی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران

کیوان آصف پور وکیلیان

گروه مهندسی مکانیک بیوسیستم، دانشکده مهندسی آب و خاک، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Aina, O., Bakare, O. O., Fadaka, A. O., Keyster, M., ...
  • Asefpour Vakilian, K. (۲۰۲۰a). Determination of nitrogen deficiency-related microRNAs in ...
  • Asefpour Vakilian, K. (۲۰۲۰b). Machine learning improves our knowledge about ...
  • Asefpour Vakilian, K. (۲۰۲۵). A smart multiplexed microRNA biosensor based ...
  • Balabin, R. M., & Lomakina, E. I. (۲۰۱۱). Support vector ...
  • Basak, P., Gurjar, M. S., Kashyap, N., Kumar, T. P. ...
  • Chen, L., Fang, Y., Zhou, X., Zhang, M., Yao, R., ...
  • Chen, H., Zhou, S., Chen, J., Zhou, J., Fan, K., ...
  • Crawford, B. M., Strobbia, P., Wang, H. N., Zentella, R., ...
  • Derakhshan, N., Rahnama, K., & Asefpour Vakilian, K. (۲۰۲۶). Plant ...
  • Ding, Y., Chen, Z., & Zhu, C. (۲۰۱۱). Microarray-based analysis ...
  • Ding, T., Li, W., Li, F., Ren, M., & Wang, ...
  • Dokhanchi, H., Babai-Ahari, A., Arzanlou, M., & Abed-Ashtiani, F. (۲۰۲۲). ...
  • Dorosti, N., Khatami, S. H., Karami, N., Taheri-Anganeh, M., Mahhengam, ...
  • Ghazvini, H. (۲۰۱۸). The host-pathogen interaction between barley and casual ...
  • Hakimian, F., & Ghourchian, H. (۲۰۲۰). Ultrasensitive electrochemical biosensor for ...
  • Johnson, B. N., & Mutharasan, R. (۲۰۱۴). Biosensor-based microRNA detection: ...
  • Kawakatsu, Y., Hara, M., Kurotani, K. I., Arima, A., Baba, ...
  • Kim, E. R., Joe, C., Mitchell, R. J., & Gu, ...
  • Li, J., Cupil-Garcia, V., Wang, H. N., Strobbia, P., Lai, ...
  • Luo, C., Bashir, N. H., Li, Z., Liu, C., Shi, ...
  • Mahdavi, Z., Dianati Daylami, S., Asefpour Vakilian, K., & Vahdati, ...
  • Marabita, F., De Candia, P., Torri, A., Tegner, J., Abrignani, ...
  • Mohammadi, P., & Asefpour Vakilian, K. (۲۰۲۳). Machine learning provides ...
  • Mourya, D. T., Yadav, P. D., Mehla, R., Barde, P. ...
  • Negahdary, M., & Angnes, L. (۲۰۲۲). Application of electrochemical biosensors ...
  • Pan, L., Zhao, H., Yu, Q., Bai, L., & Dong, ...
  • Pan, Y., Peng, Y., Lu, Y., Yao, Y., Yu, W., ...
  • Pandey, R., Teig-Sussholz, O., Schuster, S., Avni, A., & Shacham-Diamand, ...
  • Pertermann, R., Golbik, R. P., Tamilarasan, S., Gursinsky, T., Gago-Zachert, ...
  • Pervaiz, T., Amjid, M. W., El-Kereamy, A., Niu, S. H., ...
  • Rose, L. E., Overdijk, E. J., & van Damme, M. ...
  • Samadi, S. M., Asefpour Vakilian, K., & Javidan, S. M. ...
  • Seddaoui, N., & Arduini, F. (۲۰۲۵). Recent advances in wearable ...
  • Sharbati, M., Asefpour Vakilian, K., & Azadbakht, M. (۲۰۲۵). What ...
  • Sharma, N. K., Yadav, S., Gupta, S. K., Irulappan, V., ...
  • Szweykowska-Kulinska, Z., & Jarmolowski, A. (۲۰۱۸). Post-transcriptional regulation of MicroRNA ...
  • Tran, H. V., & Piro, B. (۲۰۲۱). Recent trends in ...
  • Turner, A. P. (۲۰۱۳). Biosensors: sense and sensibility. Chemical Society ...
  • Várallyay, E., Burgyán, J., & Havelda, Z. (۲۰۰۸). MicroRNA detection ...
  • Veza, I., Spraggon, M., Fattah, I. R., & Idris, M. ...
  • Volná, A., Bartas, M., Pečinka, P., Špunda, V., & Červeň, ...
  • Wang, X., Ge, J., He, M., Li, Q., Cai, J., ...
  • Yin, J. Q., Zhao, R. C., & Morris, K. V. ...
  • Zhang, Z., Long, Y., Yin, X., Wang, W., Li, W., ...
  • Zhou, Y., Ran, S., Wang, X., Huang, W., & Fang, ...
  • نمایش کامل مراجع