مقایسه چهار روش استخراج DNA از اسپورهای Aspergillus flavus

استخراج DNA ژنومی از نیازهای اساسی در مطالعات مولکولی می باشد. اغلب روش‌های استخراج تجاری معمول هزینه‌بر می‌باشند. هم‌چنین استخراج DNA از اسپورهای گونه‌های جنس اسپرژیلوس به دلیل اندازه کوچک و وجود مواد بازدارنده در ساختار اسپور نسبت به روش‌های استخراج از میسیلیوم قارچی اغلب مشکل می‌باشد. در این تحقیق چهار روش مختلف استخراج DNA از اسپورهای گونه Aspergillus flavus که عمدتاً بر پایه استفاده از بافر ستیل تری متیل آمونیوم بروماید (CTAB) هستند مورد استفاده و با روش‌های اسپکتروفتومتری و ژل اگارز و واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز مورد مقایسه قرار گرفتند. در این مطالعه در ابتدا چهار رقت از اسپور قارچ مورد نظر تهیه گردید. (103، 104، 105، 106 به ازای هر میلی‌متر) یک میلی‌لیتر از هر نمونه را در تیوب‌های 5و1 میکرولیتری ریخته و سپس میکروفیوژ گردیدند بعد از بدست آمدن پلیت اسپوری DNA را با استفاده از هریک از روش‌های استخراج مورد نظر برای هر چهار سری رقت استخراج گردید و بعد از انجام مراحل استخراج ژنوم به دست آمده با استفاده از دستگاه اسپکتروفتومتری، باندهای ایجاد شده بر روی ژل آگارز و تکثیر با پرایمرهای ناحیه ITS در واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز از نظر کیفیت و کمیت مورد مقایسه قرار گرفتند.