چند شکلی حاصل از عناصر رتروترنسپوزونی Tvv1 و Huben در ارقام انگور

رتروترنسپوزونها فراوانترین و گسترده ترین عناصر جابه جا شونده در ژنوم یوکاریوتها می باشند. چندشکلی ادغامی و فراوانی آنها درژنومهای گیاهی استفاده از آنها را به عنوان نشانگرهای ملکولی ایدهال میسازد.به منظور مطالعه فعالیت و چندشکلی ادغامی عناصررتروترنسپوزونی Tvv1 و Huben در 67 رقم مختلف انگور (.VitisviniferaL)، از نشانگرهای (amplified polymorphism Inter retrotransposon (IRAP و Retrotransposon microsatellite amplified polymorphism (REMAP) استفاده شد.از 15 آغازگرمورد استفاده، یک آغازگر IRAP و سه آغاز گر REMAP الگوی باندی واضح و چند شکل تولید نمودند. چهار آغازگر در مجموع 26 مکان تکثیر نمودند که از این تعداد 22 مکان (84/6 درصد) چند شکل بودند. در ترکیب آغازگری حاصل از دو خانواده رتروترنسپوزونی (Tvv1-Huben) باندی تولید نشد که بیانگر عدم ادغام این دو خانواده رتروترنسپوزونی در مجاور هم در ژنوم انگور میباشد. فراوانی تمام مکان های تکثیری بیش از 5 درصد بود. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار برای آغازگرها از 0/28 (آغاز گر Huben-A7) تا 0/38 (آغازگر Tvv1-849) متغیر بود. دندروگرام حاصل از تجزیه کلاستر به روش UPGMA مبتنی بر ضرایب تشابه دایس، ارقام مورد مطالعه را درهفت گروه اصلی متمایز نمود. افراد با فاصله ژنتیکی مناسب می توانند به عنوان والدین بالقوه در برنامه های اصلاحی و به نژادی انگور مورد استفاده قرار گیرند.

کلیدواژه ها:

انگور ، REMAP ، IRAP ، تجزیه کلاستر