تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک تغییرات بیان ncRNAها در مراحل رشد تخمک براساس مطالعات NGS

مقدمه ناباروری یکی از چالشهای مهم بهداشت باروری است که حدود %۱۵ از زوجها را در سراسر جهان تحت تاثیر قرار میدهد. در زنان کیفیت و کمیت تخمکها به ویژه تحت تاثیر فرآیند پیری کاهش می یابد که پیامد آن افت توان باروری و موفقیت پایین در درمانهای کمک باروری است. RNAهای غیر کدکننده (ncRNAها) به عنوان تنظیم کننده های اصلی بیان ژن در مراحل مختلف رشد اووسیت و بلوغ آن نقش ایفا می کنند. با این حال، اطلاعات دقیق در مورد الگوی بیان این مولکولها در تخمکهای پیر شده، به ویژه در شرایط in vivo و in vitro، محدود است. روش کار: در این مطالعه، داده های RNA-Seq مربوط به اووسیت موش های تحریک شده به تخمک گذاری از پایگاه داده SRA استخراج شد. پس از بررسی کیفیت تراز با ژنوم مرجع و نرمال سازی داده ها، تحلیل دیفرانسیل بیان ncRNAها در مراحل مختلف رشد فولیکولی و تخمکی انجام شد. در ادامه، برای بررسی تجربی تخمک های موش ها در شرایط in vivo aging و in vitro aging، جمع آوری و RNA استخراج گردید و بیان ncRNAهای هدف با روش های مولکولی ارزیابی شد. بحث و نتیجه: یافته ها نشان داد که در فرآیند پیری، بیان برخی از lncRNAها و miRNAها به طور معنی داری تغییر می کند. این تغییرات عمدتا در مسیرهای مرتبط با بلوغ اووسیت، چرخه سلولی و آپوپتوز مشاهده شد. الگوهای بیان شناسایی شده می توانند بازتاب دهنده سازوکارهای مولکولی درگیر در افت کیفیت تخمک باشند. تحلیل های مردادماه ۱۴۰۴

کلیدواژه ها:

بیوانفورماتیک ، ncRNA ، تخمک ، NGS ، تحریک تخمک ، in vivo aging ، in vitro aging