طراحی پروتئین فیوژن نوترکیب برای درمان هدفمند سرطان

طراحی پروتئینهای فیوژن نوترکیب به عنوان یکی از راهبردهای نوین در درمان هدفمند سرطان با هدف افزایش اختصاصیت سلول هدف و کاهش سمیت داروهای ضدسرطان در سالهای اخیر مورد توجه گسترده ای قرار گرفته است. این پروتئینها با ترکیب نواحی شناسایی کننده سطح سلولهای سرطانی (نظیر آنتی بادیها، لیگاندها یا سایتوکاینها) با بخشهای سمی یا مداخله گر قادر به القای مرگ انتخابی سلولهای توموری می باشند. در این مطالعه سه نوع فیوژن پروتئین نوترکیب با اهداف درمانی علیه سرطان طراحی شد که شامل: ۱- متشکل از آنتی بادی ضد HER۲ و اگزوتوکسین Pseudomonas؛ EGF-DT۲، ۲- ترکیب عامل رشد اپیدرمی و دیفتری توکسین و IL-RIP۳، ۳- متشکل از اینترلوکین ۲ و پروتئین غیر فعال کننده ریبوزوم می باشد. طراحی و ارزیابی این پروتئینها با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و شبیه سازیهای دینامیک مولکولی در فضای in silico انجام شد. ابتدا توالی های مورد نظر انتخاب و بهینه سازی شدند، سپس با کمک نرم افزارهای ساختاردهی سه بعدی مدلهای پروتئینی ایجاد و پایداری آنها از طریق شبیه سازیهای دینامیکی بررسی شد. در ادامه خصوصیات فارماکوکینتیکی، پتانسیل ایمونوژنی و احتمال حساسیت زایی هر ساختار مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج حاصل نشان داد که هر سه پروتئین طراحی شده از نظر پایداری ساختاری، عدم ایمنی زایی و ویژگیهای جذب، توزیع و دفع در سطح قابل قبولی قرار دارند. این یافته ها بیانگر کارایی بالای روشهای محاسباتی در طراحی درمانهای هدفمند جدید بوده و زمینه ساز توسعه آزمایشهای آزمایشگاهی و بالینی برای تولید داروهای نوین علیه سرطان می باشد.

کلیدواژه ها:

پروتئین فیوژن نوترکیب ، درمان هدفمند سرطان ، بیوانفورماتیک ، شبیه سازی دینامیک مولکولی