مقایسه مولکولی جدایه های Rhizoctonia solani AG-2-1 عامل شانکر ساقه کلزا در استان های شمالی ایران با استفاده از تکنیک ITS-RFLP

قارچ Rhizoctonia solani از مهمترین عوامل محدود کننده کشت گیاهان در اکثر مناطق دنیا می باد. در این تحقیق برخی ایزوله های Rhizoctonia solani AG-2-1 به دست آمده از گیاهان کلزا با علائم شانکر ساقه از مزارع استان های مازندران و گلستان با استفاده از تکنیک ITS-RFLP با هم مقایسه شدند. پس از تکثیر قطعه 666 جفت بازی ناحیه (Internal Transcribed Spacer)ITS جدایه ها با استفاده از جفت آغازگرهای ITS4 و ITS5 ، محصولات PCR حاصله با استفاده از آنزیم های برشگر HinfI, AvaII, HincII و TagI برش داده شدند. هضم محصولات PCR با استفاده از آنزیم HinfI در تمامی جدایه ها منجر به حاصل شدن 2 قطعه 380 و 390 جفت بازی گردید. هضم محصول PCR جدایه ها با آنزیم AvaI نیز منجر به برش تمامی جدایه ها در یک ناحیه شده که از این برش باندهای 130 و 530 جفت بازی به دست آمد. زمانی که ناحیه تکثیر شده جدایه ها با آنزیم برشگر HincII برش داده شد باندهای 260 و 430 جفت بازی حاصل آمد. تمامی جدایه ها دارای 1 ناحیه برش برای آنزیم TagI بوده و از هضم محصول PCR نمونه ها با این آنزیم برشگر باندهای 350 و 370 جفت بازی حاصل آمد. نتایج این تحقیق نشان داد جدایه های Rhizoctonia solani AG-2-1 عامل شانکر ساقه کلزا در ایران مونوژن بوده و ITS-RFLP با استفاده از آنزیم های برشگر HinfI, AvaII, HincII و TagI تفاوتی بین جدایه های مازندران و گلستان از نظر الگوی برش آنزیمی نشان نداد.

کلیدواژه ها:

آنزیم برشگر ، کلزا ، محصول PCR و مونوژن