آنالیز بیوانفورماتیکی نواحی پروموتری ژنهای دخیل در غیراشباع سازی اسیدهای چرب (FAD) در گیاه مدل آرابیدوپسیس جهت کشف سایت های اتصال فاکتورهای رونویسی و بررسی انطباق این نواحی با عملکردهای متنوع این ژنها

تغییر درجه غیراشباع سازی اسیدهای چرب بواسطه عمل اسید چرب دساچورازها (FADs)، در پاسخ های گیاهی به استرس های غیرزنده و زنده نقش دارد. ژنهای FAD، الگوی بیان اختصاصی بافت را نیز نشان می دهند. ترکیب اختصاصی سایت های اتصال فاکتورهای رونویسی، بیان ژن و بنابراین فرایندهای کلیدی سلول ها را تنظیم می کند. در این پژوهش، نرم افزار Gene 2 promoter، برای کسب سایت های پروموتری 11 ژن FAD استفاده گردید. 9 خانواده ماتریسی بدست آمد که 5 مورد از آنها P-Value کمتر از 0/05 داشتند که شامل ماتریس فامیلیهای P$MYBL, P$IBOX, P$GTBX, P$AHBP و P$SUCB می بشند. P$AHBP در پاسخ مقاومتی به پاتوژن ها، سیگنال دهی نوری و ا سترسی، بلوغ دانه، نمو گل، تعیین الگوی جنینی، حفظ خاصیت بنیادی بودن سلول های بنیادی گیاهی و تشکیل اندام های گیاهی نقش دارد. P$GTBX بعنوان یک عنصر تنظیمی سپس GT-BOX و همراه با عناصر GATA، بیان قابل القا با نور و همچنین، بیان ژنهای مرتبط با پاتوژنز را باعث می شود، MYBL، در پیری برگ و بهبود سرعت جوانه زنی دانه نقش دارد و پاسخ به استرس های غیر زنده را تعدیل می کند. نتایج این پژوهش، وجود عناصر تنظیمی سیس، که توجیه کننده نقش های پیچیده و متنوع ژنهای FAD می باشد را به خوبی نشان و وجود عنصر جدید SucB را نیز پیشنهاد می دهد.

کلیدواژه ها:

اسید چرب دساچوراز ، پروموتر ، فاکتورهای رونویسی ، عملکردهای متنوع