فیلوژنی کاربردی شاخه گیاهان بر اساس توالی اسید آمینه آنزیم استیل کوآنزیم آکربوکسیلاز و معرفی نواحی چهارگانه عملگرای آن

موضوع استفاده از توالیهای ژنوم کلورپلاستی در بازسازی و یافتن روابط جدید فیلوژنی مولکولی گیاهی در دهه اخیر اهمیت زیادی یافته است. در این مطالعات ضمن شناسایی عملکرد ژنهای کلروپلاستی توسط انجام مطالعات ژنتیکی و بیوانفورماتیکی، سعی در یافتن نواحی می شود که به عنوان یک شاه کلید دسته بندی مناسب و شناسایی مولکولی دقیقی را در شناسایی گونه های گیاهی فراهم آورد. در این مقاله سعی بر این است که با بررسی مقایسه ای و کاربردی در سطح تالی اسید آمینه آنزیم استیل کوآنزیم آکربکسیلاز (AccD) کلروپلاستی که متعلق به یک خانواده ژنی سازنده یک آنزیم هترومر است، روابط خویشاوندی و میزان تنوع ژنتیکی این شاخه از جانداران توصیف شود. برای مطالعه توالی های اسید آمینه از نرم افزارهای Bioedit و MEGA استفاده شد و نمودارهای فیلوژنتیک و ماتریس فواصل بدست آمد. نتایج نشان داد که استفاده از توالی اسید آمینه آنزیم AccD کلورپلاستی، بر خلاف همتای هسته ایش، بخوبی توانایی دسته بندی افراد در سطوح بالای تاکسونومی را دارا است به نحوی که کاملاً گروه های اجدادی و پیشرفته گیاهی را از یکدیگر متمایز می سازد. مطالعات بیشتر در مورد منشأ تکاملی این آنزیم، منجر به شناسایی و معرفی مناطق کنش گر این آنزیم شد که می تواند در اصلاح گیاهان روغنی و مهندسی آنزیم قویتر، مورد بهره برداری قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

فیلوژنتیک ، مهندسی پروتئین ، AccD