بررسی تنوع ژنتیکی خوشه ژنی هارپین در جدایه های باکتری Erwinia amylovora
محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 937
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0275
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
چکیده مقاله:
یکی از نواحی بسیار مهم باکتری عامل آتشک، E. amylovora، در فرآیند بیماریزایی، بخشی به طول تقریبی 40 کیلو باز از ژنوم کروموزومی، بهنام خوشه ژنی هارپین بوده که عامل ایجاد بیماری در گیاهان میزبان، تحریک واکنش فوق حساسیت در گیاهان غیرمیزبان، تراوش سلولی و تولید پروتئینهای هارپین می باشد. در تحقیق حاضر تنوع ژنتیکی جدایه های مختلف باکتری E. amylovora با پراکنش جغرافیایی در بخشهایی از خوشه ژنی هارپین با استفاده از روش PCR-RFLP مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور با یافتن نواحی جداکننده بین ژنی و نیز تعیین ژنهای اصلی این خوشه به عنوان بخشهای حفاظت شده، اقدام به طراحی سه جفت آغازگر دربرگیرنده فواصل بین ژنی شامل جفت آغازگرهای HRPL, HRPW و HRCU گردید. DNA ژنومی جدایه ها استخراج و مورد ارزیابی کمی و کیفی قرار گرفتند. پس از انجام واکنش PCR و تولید محصولات، آزیمهای محدودگر MboI, TaqI, AluI, PstI, و Bg/II به عنوان آنزیمهای تأثیر گذار بر روی توالی تکثیر شده انتخاب و هضم کامل آنزیمی صورت گرفت. نتایج حاصل عدم وجود تفاوت و تنوع در بخش ژنی مورد نظر، چه در تولید محصولات PCR و چه در طول قطعات حاصل از هضم با آنزیم را به اثبات رساند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سمیرا رهیده
دانشجوی کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران، ایران
حمید عبداللهی
دانشیار بخش تحقیقات باغبانی، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، کرج
غلامرضا صالحی جوزانی
استادیار بخش تحقیقات بیوتکنولوژی میکروبی و ایمنی زیستی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :