تجزیه و تحلیل مقایسه ای شبکه های هم بیان ژنی خانواده دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز (DGAT) در گاو و انسان

شناسایی ژن های هاب مرتبط با خانواده ژن های دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز (DGAT) در گاوهای شیری برای درک زیست سامانه تولید شیر حیاتی است، زیرا این ژن ها مستقیما بر میزان چربی شیر و کیفیت اسیدهای چرب تاثیر می گذارند. این پژوهش با هدف شناسایی ژن ها و ماژول های ژنی مرتبط با خانواده DGAT و ورم پستان در گاو انجام شد. به­عبارتی دیگر، پژوهش حاضر با هدف شناسایی ژن های هاب مرتبط با خانواده DGAT در انسان و بررسی پتانسیل آن ها به­عنوان ژن های مرتبط با ورم پستان در گاو انجام شد. هدف اصلی، شناسایی ژن های کلیدی در سوخت و ساز چربی بود که ممکن است در شبکه های ژنی مرتبط با ورم پستان نیز نقش داشته باشند. در این راستا، به­دلیل محدودیت داده های بیان ژنی مرتبط با DGAT در گاو، از داده های بیان ژنی گونه انسان (GSE۵۱۸۷۴) و گاو (GSE۲۴۵۶۰) استفاده شد. پس از پیش پردازش داده ها، ژن های متفاوت بیان شده (DEGs) استخراج و با استفاده از روش های خوشه بندی، تحلیل مولفه های اصلی (PCA) و شبکه سازی هم بیانی (WGCNA) تحلیل شدند. غنی سازی زیستی با ابزار Enrichr انجام شد. در داده های انسان، ژن های DGAT۱، DGAT۲L۶ و MOGAT۱ به­عنوان ژن های هاب شناسایی شدند، در حالی که در داده های گاو، IL۱B و CXCL۶ به­عنوان ژن های هاب برجسته شدند. تجزیه و تحلیل هستی شناسی ژن ها نشان دهنده ارتباط قوی با سوخت و ساز لیپید، به­ویژه در ساخت و سوخت و ساز آسیل گلیسرول ها و تری گلیسیریدها بود. فرآیندهای زیستی غنی شده شامل بیوسنتز آسیل گلیسرول (GO:۰۰۴۶۴۶۳)، مونوآسیل گلیسرول (GO:۰۰۰۶۶۴۰) و تری گلیسیرید (GO:۰۰۱۹۴۳۲) بودند. با این حال، هیچ شواهد قاطعی مبنی بر اینکه ژن های DGAT انسانی مستقیما در ایجاد یا پیشرفت ورم پستان در گاو نقش دارند، یافت نشد. نتایج این پژوهش می تواند به شناسایی ژن های کاندید جدید برای بررسی بیشتر در زمینه ورم پستان در گاو کمک کند. این پژوهش، بینش هایی در مورد شبکه های ژنتیکی تنظیم کننده تولید شیر و ورم پستان ارائه می دهد و می تواند به توسعه راهبردهای پرورشی هدفمند کمک کند.

کلیدواژه ها:

بیان ژن ، دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز ، ژنوم گاو ، ژن های هاب ، شبکه ژنی