بررسی ناحیه پروموتری ژن kinl و بیان آن در آرابیدوپسیس تالیانا

تنش های محیطی از عوامل محدود کننده رشد گیاهان می باشند، از این رو بهبود و افزایش تحمل به تنش در گیاهان زراعی از اهداف مهم است. بسیاری از گونه های گیاهی در معرض دمای پائین، با افزایش بیان برخی از ژن ها، تحمل به سرما را در خود افزایش می دهند. از جمله این ژن ها kinl در آرابیدوپسیس است که به تنش های سرما، اسمزی، خشکی و آبسزیک اسید پاسخ می دهد. برای اطلاع از مسیر بیولوژیکی و عملکرد ژن kinl شناسایی شبکه های ژنی مرتبط بررسی بیان آن ضروری است. بررسی پروموتر ژن های موجود در این شبکه ژنی منجر به شناسایی عناصر تنظیمی اختصاصی جدیدی خواهد شد که در تهیه پروموترهای مصنوعی مؤثر خواهند بود، از این رو CDS ژن kinl از سایت TAIRاستخراج و حدود 1070 جفت باز از بالا دست کدون شروع به عنوان پروموتر، توسط سایت PLANT CARE آنالیز شد. برای بررسی بیان، از سایت efp Browser استفاده شد و در نهایت، با استفاده از سایت string9 شبکه ژنی ترسیم گردید. نتایج نشا داد دو موتیف ABRE و DRE که به ترتیب پاسخ دهنده به آبزیک اسید و تنش های کمبود آب هستند باعث نقش ضد انجمادی این پروتئین می شوند. با بررسی نحوه عملکرد KINl تحت تنش غیر زنده مشخص شد با اعمال تنش های مختلف به ویژه سرما بیان این ژن در بافت ریشه و ساقه افزایش می یابد و ترسیم شبکه ژنی موید این مطلب بود که این ژن در مسیر تحمل به سرما نقش اساسی داشته و با سایر ژن های درگیر در این مسیر هم بیانی دارد و باعث نجات گیاه از مرگ حتمی می شود.

کلیدواژه ها:

، kirl ، آنالیز پروموتر ، تحل سرما ، آرابیدوپسیس تالیانا