شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با ذخیره چربی در برخی از نژادهای گوسفند آسیایی و آفریقایی بر پایه روش نشانه های انتخاب

پژوهش حاضر با هدف شناسایی مناطق ژنومی، ژن های کاندید و مسیرهای زیستی موثر بر ذخیره چربی در دنبه در برخی از نژادهای گوسفند آسیایی و آفریقایی بر اساس بررسی نشانه های انتخاب و آنالیز غنی سازی مجموعه های ژنی انجام شده است. بدین منظور، از مجموع اطلاعات ژنومی مربوط به ۴۹۰۳۴ جایگاه نشانگری SNP متعلق به ۴۰۴ نمونه حیوان شامل ۱۳ نژاد دنبه دار و ۷ نژاد بدون دنبه، با ابعاد دنبه و دم نسبتا مشابه که در مناطق مختلف آسیا و آفریقا پراکنش داشتند، استفاده شد. جهت بررسی نحوه قرار گرفتن حیوانات در گروه های نژادی خود از آنالیز مولفه های اصلی (PCA) و برای ردیابی نشانه های انتخاب مثبت از آزمون نااریب FST (تتا) استفاده شد. سپس ژن های گزارش شده در مناطق تحت انتخاب شناسایی گردید و آنالیز غنی سازی مجموعه ژنی با هدف شناسایی مسیرهای بیولوژیکی (و ژن های کاندیدای) مرتبط با ذخیره چربی انجام شد. آنالیز مولفه های اصلی (PCA) نشان داد که تمام حیوانات در گروه های نژادی خود قرار می گیرند و نژادهای دنبه دار و بدون دنبه را می توان بر اساس مولفه های مختلف از هم تفکیک نمود. در این پژوهش ۱۹ منطقه ژنومی تحت انتخاب بین نژادهای دنبه دار و بدون دنبه شناسایی شد. بررسی ژن های گزارش شده در این مناطق منجر به شناسایی چندین مسیر بیولوژیکی (و ژن های کاندیدا) شد که به طور مستقیم یا غیر مستقیم با مورفولوژی دم (NDUFB، ANO۴، ASXL۲، ABHD۲ و NID۲)، اندازه دنبه (ACADL)، اسکلت و یا ساختار اندازه بدن (PDGFD، ACAN،HOXC ،HOXB ، BMP۲ و (BMP۴، پاسخ ایمنی (ATG۵، IL۴، IL۵ و IL۱۳) و تنظیم ملانوسیت ها (KITLG) مرتبط می باشند.

کلیدواژه ها:

ژن های کاندید ، شاخص تمایز جمعیتی ، گوسفندان آسیایی ، گوسفندان آفریقایی ، نشانه های انتخاب