شناسایی مولکولی باکتری های مولد گال در درختان میوه هسته دار و دانه دار با استفاده از توالی ژن recA

بیماری گال طوقه یکی از بیماری­های مهم از لحاظ اقتصادی در انواع گیاهان باغی، زراعی و زینتی محسوب می شود. باکتریAgrobacterium tumefaciens ، عامل بیماری است که می­تواند به­صورت غیرفعال در خاک و به­صورت فعال در گیاه میزبان بقاء یابد. در این مطالعه، از توالی ژن recA جهت ارزیابی کارآیی آن در شناسایی و تبارشناسی جدایه­های گال­زای دو گونه Agrobacterium tumefaciens و Agrobacterium rubi استفاده شد. جدایه­های بیماری­زای این مطالعه، از گال­های ایجاد شده روی شاخه­های درختان گیلاس، آلو و سیب در باغات ارومیه، نقده، سردشت و خوی واقع در استان آذربایجان غربی جداسازی شدند. شناسایی فنوتیپی جدایه­ها و آزمون بیماری­زایی با تشکیل گال روی طوقه گوجه­فرنگی در مطالعات قبلی انجام شده بود. پس از استخراج DNA، واکنش زنجیره­ای پلی­مراز با استفاده از آغازگرهای ۹۱F/۵۹۵R جهت تکثیر ژن recA انجام شد. قطعه ۴۶۲ جفت بازی در همه جدایه­های باکتریایی تکثیر شد. مقایسه توالی ژن recA در جدایه­های باکتری، شباهت ۹۵/۹۹ تا ۱۰۰ درصد را با توالی­های سویه­های مرجع باکتری A. tumefaciens ثبت شده در بانک ژن نشان داد. در درخت تبارزایی، از توالی ژن recA جدایه­های این مطالعه و سویه­های مرجع A. tumefaciens و A. rubi استفاده شد. درخت تبارزایی شامل دو شاخه اصلی بود. جدایه­های این مطالعه به همراه سویه­های مرجع A. tumefaciens از کشورهای مختلف در شاخه اول که خود شامل دو زیرشاخه بود، قرار گرفتند. در شاخه دوم، سویه­ای از باکتری A. rubi مجزا از جدایه­های A. tumefaciens قرار گرفت. نتایج درخت تبارزایی نشان داد که این ژن، کارآیی کافی در تفکیک باکتری­های A. tumefaciens و A. rubi را دارد، به­طوری­که سویه­های باکتری A. rubi در شاخه­ای مجزا از سویه­های A. tumefaciens قرار گرفتند. با توجه به این نتایج، پیشنهاد می­شود که در شناسایی و بررسی روابط تبارشناسی گونه­های جنس Agrobacterium، از توالی ژن خانه­داری recA استفاده شود تا نتایج دقیق­تری از موقعیت آرایه­های این باکتری­ها به­دست آید.

کلیدواژه ها:

آرایه بندی ، باکتری های گال زا ، ژن خانه داری ، گال طوقه