داکینگ مولکولی تعدادی از مواد موثره گیاه رزماری به عنوان مهارکننده پیش ساز بتا-آمیلوئید

مقدمه: امروزه درمان بیماریها با گیاهان دارویی به علت ویژگی ها و ترکیبات موثره فراوان مورد استقبال پژوهشگران قرار گرفته است. کاربرد بیوانفورماتیک باعث شده مطالعات سریع تر شده و احتمال پیش بینی تعاملات مولکول های مختلف را فراهم می کند. هدف این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار مولکول NAC به عنوان بخش اصلی آمیلوئید بتا به وسیله برخی مواد موثره گیاه رزماری است. این پژوهش به روش توصیفی – تحلیلی انجام شد. برای بررسی نحوه اتصال مواد موثره رزماری به NAC، در ابتدا ساختار شیمیایی ترکیبات ترسیم شد. سپس به منظور بهینه سازی انرژی، به نرم افزار Hyperchem انتقال یافت. مطالعات داکینگ به وسیله نرم افزار AutoDock ۴.۲ و Vina انجام شد و در مرحله نهایی، نتایج با استفاده از سه برنامه AutoDockTools، Visualizer DS و Ligplot مورد آنالیز قرار گرفتند. بر اساس نتایج به دست آمده از مطالعات داکینگ، مهم ترین پیوندهای درگیر در اتصال دارو با گیرنده، اتصالات هیدروفوبیک هستند. در میان تمام ترکیبات مورد مطالعه، بهترین نتایج داکینگ مربوط به ترکیب شماره ۴ است. این ترکیب با منفی ترین سطح انرژی اتصال (-۷.۸) تمایل بیشتری برای اتصال به اسیدهای آمینه NAC دارد. در پایان با توجه به اثربخشی باال و نتایج داکینگ می توان نتیجه گرفت که ترکیب شماره ۴ می تواند تاحدودی موجب مهار NAC گردد.

کلیدواژه ها:

آمیلوئید بتا ، بیوانفورماتیک ، داکینگ مولکولی ، رزماریک اسید