مقاله علمی – پژوهشی: بررسی تنوع ژنتیکی شش گونه از ماهیان اقتصادی در منطقه خلیج فارس با استفاده از ژنوم ۱۶SrRNA

سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 85

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ORAQ-11-4_002

تاریخ نمایه سازی: 11 اسفند 1403

چکیده مقاله:

کاهش ذخایر آبزیان در نقاط مختلف جهان موجب شده است که پژوهشگران علوم شیلاتی پیش از هر گونه اقدام عملی در راستای مدیریت ذخایر آبزیان اقتصادی، ماهیان زینتی و ماهیان جنگل های مانگرو، به بررسی و تعیین ساختار ژنتیکی گونه های با ارزش آن منطقه از طریق روش های مولکولی بپردازند. بنابراین، شناخت ساختار ژنتیکی گونه های مختلف اقتصادی خلیج فارس از جمله شش گونه مذکور، پیش از هرگونه اقدام عملی برای حفظ و افزایش این ذخایر ضروری به نظر می رسد. در این پژوهش، نواحی خاصی از ژنوم میتوکندریایی (mtDNA)به نام ۱۶SrDNA با موفقیت تکثیر و تعیین توالی شد. در این فرآیند، حدود ۶۵۰-۶۰۰ جفت باز آمپلی فای شده و بازهای قابل اعتماد از هر ژن برای بررسی فایلوژنی انتخاب گردیدند. نمونه برداری از مناطق هدف که شامل اصلی ترین زیستگاه های منحصربه فرد شش گونه مورد مطالعه در خلیج فارس است، انجام شد. این گونه ها شامل راشگو معمولی(Eleutheronema tetradactylum) ، صبیتی(Sparidentex hasta) ، سنگسر معمولی (Pomadasys kaakan)، شوریده(Otolithes ruber) ، میش ماهی منقوط (Protonibea diacanthus)   و حلوا سفید(Pampus argenteus)  می باشند. این گونه ها از مهم ترین موجودات دریایی در این منطقه شناخته می شوند و نمونه برداری در زیستگاه های طبیعی آنها صورت گرفت. طبق روش استاندارد، از هر نمونه حداقل پنج قطعه از باله شنای گونه های مورد مطالعه برای انجام تحلیل های مولکولی و شناسایی دقیق گونه ها جدا شد. در این تحقیق، گونه راشگو (Eleutheronema tetradactylum ) به عنوان یک هاپلوتایپ مجزا در کنار نمونه هایی از مالزی و جین در کلاید سوم به همراه نمونه ای از میش ماهیان شناسایی گردید. همچنین نمونه ای از میش ماهی غالب ((Protonibea diacanthus در منطقه خوزستان در مقایسه با نمونه ای از میش ماهی معمولی (Argyrosomus hololepidotus) در استان هرمزگان مشاهده شد که نشان دهنده غالب بودن گونه منقوط در غرب خلیج فارس نسبت به گونه میش ماهی معمولی (Argyrosomus hololepidotus)  در شرق خلیج فارس است. اگر این فرضیه به اثبات برسد، می توان این گونه را به عنوان یک گونه یا مورفوتایپ جدید و اندمیک منطقه خلیج فارس مورد بررسی قرار داد. این گونه به همراه ماهی شوریده، در قالب کلاستر خواهری با اختلاف یازده درصدی، به همراه نمونه هایی از کشور هند، کلاید دوم را کامل می کند. ماهی سنگسر معمولی با اختلاف بالاتری نسبت به پنج گونه مذکور دیگر، در کلاید اول قرار گرفت و اختلافی در بین نمونه های این گونه از هرمزگان و خوزستان مشاهده نشد. اما این گونه با نمونه ای از چین اختلاف نه درصدی را نشان داد که نمایانگر عدم مهاجرت و کاهش انتقال آلل های بین جمعیتی است .اگرچه این گونه با گونه حلوا سفید در همین کلاید با اختلاف دوازده درصدی و با گونه صبیتی  با اختلاف چهارده درصدی کلاستر خواهری را نشان داد. این تحقیق نشان می دهد که استفاده از توالی ۱۶SrDNA می تواند اطلاعات ارزشمندی درباره ساختار جمعیتی ماهیان، روابط ژنتیکی بین گونه ها در منطقه خلیج فارس و وضعیت اکولوژیک این منابع فراهم کند. همچنین این یافته ها می توانند به مدیریت بهتر منابع آبزی و حفظ تنوع زیستی و برنامه ریزی های مدیریتی و حفاظتی کمک کنند.

نویسندگان

رضا نهاوندی

Animal Science Research Institute of Iran (ASRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran

سعید تمدنی جهرمی

Persian Gulf and Oman Sea Ecology Research Center, Iranian Fisheries Sciences Research Institute, Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Bandar Abbas, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Azahar, M.A., Rosli, A., AB Rahman, N.S., BADRULHISHAM, N.S., Solehin, ...
  • Chen, M., Yang, J., He, H., Chen, Y., Chen, Z. ...
  • Fitri, D.A., Mashar, A. and Ayu, I.P., ۲۰۲۴. Genetic diversity ...
  • Habib, K.A., Islam, M.J., Sakib, M.N., Brishti, P.S. and Neogi, ...
  • Hairani, H., Amelia, R., Susetya, I.E., Susilowati, A., Bimantara, Y., ...
  • Huang, W.C., Evacitas, F.C., Balisco, R.A., Nañola, C.L. Jr, Chou, ...
  • Mahboobeh, A., Sourinejad, I., Shahdadi, A. and Vera, M., ۲۰۲۳. ...
  • Mer Mosharraf Hossain, M., Mojumdar, S., Farjana, N., Saiful Islam, ...
  • Panprommin, D., Soontornprasit, K., Tuncharoen, S., Pithakpol, S., Kannika, K. ...
  • Pinasti, R., Ilmi, W. and Suryani, T.A., ۲۰۲۱. Genetic characterization ...
  • Ram, R., Pavan-Kumar, A. and Ashok K., ۲۰۲۰. Jaiswar, Pathakota ...
  • Simon, C., Franke, A. and Martin, A., ۱۹۹۱. The polymerase ...
  • Taggart, J., McNally, S. & Sharp, P., ۱۹۹۰. Genetic variability ...
  • Tavakoli-Kolour, P., Farhadi, A., Ajdari, A., Bagheri, D., Hazraty-Kari, S., ...
  • Xiao, J., Lyu, S., Iqbal, Iqbal, T.H. Hajisamae, S., Tsim, ...
  • Zhang, J., Xu, L., Du, F., Tang, Q., Wang, L., ...
  • Zhang, J.B. and Hanne, R., ۲۰۱۱. DNA barcoding is a ...
  • نمایش کامل مراجع