پیش بینی ساختار سه بعدی سرین /ترئونین پروتئین -کیناز (SAPKs) در گیاه برنج با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 274
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
MPSA18_002
تاریخ نمایه سازی: 20 دی 1403
چکیده مقاله:
پروتئین -کیناز (SAPKs) در گیاه برنج یک آنزیم کیناز است که گروه OH در اسیدآمینه های سرین و ترئونین را فسفریله می کند. این آنزیم ها از خانواده ترانسفرازها بوده و در فسفریلاسیون پروتئین در بسیاری از فرآیندهای سلولی نقش دارد. هم چنین این آنزیم ها اهمیت فراوانی در تغییرات پس از رونویسی مانند گل یکوریلاسیون دارند. تعیین ساختار پروتئین یکی از مسائل مهم در حوزه بیوانفورماتیک و شیمی تئوری است . نتایج حاصل از Blastp توالی پروتئین SAPKs در گیاه برنج با سایر پروتئین ها در سایت NCBI نشان داد که توالی پروتئینی گیاه نیشکر بیشترین قرابت را با پروتئین -کیناز دارد و ۸۵% هم پوشانی دارد بنابراین از لحاظ ساختاری نیز شبیه این پروتئین در برنج است . برای تعیین ساختار سه بعدی پروتئین SAPKs، توالی پروتئین از سایت NCBI دریافت شده و پس از همردیفی با سایر پروتئین هاساختار سه بعدی پروتئین ، با استفاده از نرم افزار SWISS MODEL پیش بینی شده و مارپیچ آلفا و صفحات بتا در نرم افزار Pymol مشخص گردید.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سکینه پادیاب
دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی،ایران.
نورالدین حسین پوآزاد
عضو هیات علمی گروه علوم گیاهی و گیاهان دارویی، دانشکده کشاورزی مشگین شهر، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ا یران.
