پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی با استفاده از پروفایل انرژی

در این مقاله پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی بر پایه توالی اسید های آمینه آن ارائه خواهد شد. برای تعریف فاکتوری به منظور تشخیص میزان انعطاف پذیری از انرژی دو اسید آمینه متوالی استفاده شد. با استفاده از تحلیل های آماری برروی این انرژی، عددی بین صفر و صد به هر جفت اسید آمینه تعلق می گیرد که آنرا عدد انعطاف پذیری می نامیم. در نظر گرفتن اثرات همسایه ها تا چهار همسایه اسید آمینه باعث بهبود پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئین می گردد. برای ارزیابی پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی از پروتئین هایی که ساختمان آنها توسط NMR تعیین ساختار شده بود استفاده شد. عدم قطعیت در تعیین ساختار مناطقی که انعطاف پذیری بالایی دارند، مثل سر و ته زنجیره و حلقه ها باعث ایجاد مدل های مختلف ساختمانی می شود. مقایسه بین پیشگویی و پراکندگی زوایا در مدل های مختلف همبستگی بالایی را نشان می دهد که حاکی از دقت قابل اعتماد روش پیشگویی می باشد.

کلیدواژه ها:

conformational flexibility ، protein function prediction ، flexible/rigid region prediction ، protein structure prediction ، انعطاف پذیری ساختمانی ، پیشگویی عملکرد پروتئین ، پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئین ، پیشگویی ساختمان پروتئین