بررسی نقش خانواده ژنی پروتئین شوک حرارتی (HSP۷۰) در آرابیدوپسیس

پروتئین های شوک حرارتی (HSPs) در گیاهان به ویژه Hsp۷۰، در پاسخ به تنش های حرارتی و حفظ پایداری ساختار پروتئین ها نقش حیاتی ایفا می کنند. در این مطالعه ، ۱۶ ژن کدکننده پروتئین HSP۷۰ در ژنوم آرابیدوپسیس تالیانا (Arabidopsis Thaliana) شناسایی و خصوصیات فیزیکوشیمیایی ، جایگاه سلولی ، موتیف های حفاظت شده و ساختار ژنی آنها تعیین و روابط فیلوژنتیکی بین این پروتئین ها مد نظر قرار گرفت . نتایج نشان داد که طول ۱۶ توالی نوکلئوتیدی HSP۷۰ آرابیدوپسیس از ۳۴۰۵-۲۰۹۵ نوکلئوتید متغیر بود. اکثر این ژنها بر روی کروموزوم شماره ۱ و ۵ قرار داشتند. بیشترین محل حضور ژن HSP۷۰ درون شبکه آندوپلاسمی ، هسته ، سیتوپلاسم و کلروپلاست است . در تمامی این توالی ها ده موتیف شناسایی شد. بررسی درخت فیلوژنتیکی نشان داد توالی های NP_۵۶۷۵۱۰.۱.۱ و NP_۰۰۱۳۲۹۷۵۱.۱ در یک گروه مجزا نسبت به سایر توالی ها قرار گرفته اند. در این مطالعه پروتئین HSP۷۰ با شماره دستیابی NP_۰۰۱۳۳۱۸۲۴ با مقدار ۲۷/۳۰ پایدارترین و توالی پروتئینی باشماره دستیابی NP_۰۰۱۳۲۲۱۲۶ و مقدار ۲۲/۵۱ ناپایدارترین توالی از دیگر توالی ها بودند. بالا بودن ضریب خاموشی در تمام توالی ها به خصوص توالی NP_۰۰۱۳۲۹۷۵۱ نشان دهنده طول عمر بالای پروتئین هاست .

کلیدواژه ها:

پروتئین های شوک حرارتی ، ساختار سه بعدی ، فیلوژنتیکی ، موتیف