پویش ژنومی بر پایه آنالیز چند جمعیتی مشترک مرتبط با صفت تعداد نتاج متولد شده در گوسفندان نژاد بومی و خارجی

تعداد بره متولد شده در هر زایش یکی از مهم ترین صفات اقتصادی و تولیدمثلی در گوسفند است. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی مناطق ژنومی و ژن­های کاندیدای مرتبط با چندقلوزایی در نژادهای مختلف گوسفند با رویکرد مگاآنالیز پویش ژنومی از طریق استفاده از اطلاعات مربوط به سه نژاد زندی، راهمنی و کایاس می­باشد. بدین منظور، از اطلاعات ژنوتیپی و فنوتیپی ۶۸۲ راس دام شامل نژادهای زندی (۹۶)، راهمنی (۴۸) و کایاس (۵۳۸) تعیین ژنوتیپ شده با از آرایه­های ۵۰K گوسفندی، استفاده شد. پس از مراحل مختلف کنترل کیفیت و ادغام داده­های تعیین ژنوتیپ شده، ۶۷۱ راس دام و ۴۵۱۶۷ نشانگر SNP برای ادامه آنالیزهای پویش ژنومی مورد استفاده قرار گرفتند. مگاآنالیز با استفاده از مدل خطی مختلط در نرم­افزار TASSEL با در نظر گرفتن روابط خویشاوندی و ساختار جمعیتی انجام شد. نتایج حاصل نشان داد که تعداد نه نشانگر روی کروموزوم­های شماره ۱ (دو نشانگر)، ۲، ۳ (دو نشانگر)، ۱۰، ۱۳ (دو نشانگر) و ۲۲ به طور معنی­داری با صفت چندقلوزایی مرتبط می­باشند. بررسی مناطق ژنومی کاندیدا به وسیله پایگاه­های داده­ای برخط نشان داد ژن­های کاندیدای DLG۱، CLSTN۲، INHBE­، TCFL۵ و RBP۴ نقش موثری در باروری، آبستنی موفق، فرآیند آزادسازی تخمک و اوولاسیون دارند. نتایج این پژوهش می­تواند در درک ساز و کار ژنتیکی کنترل کننده چندقلوزایی در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

آنالیز پیوستگی ، بهبود باروری ، مگاآنالیز ، ناحیه ژنومی ، نشانگر ژنتیکی