بررسی تنوع ژنومی باکتری های تولید کننده آنزیم های زنوبیوتیک در نمونه های خاکمناطق افراطی

زنوبیوتیک، به ترکیباتی گفته می شود که به صورت طبیعی در داخل سلول های زنده یوکاریوتی و پروکاریوتیوجود ندارند و به عبارت دیگر ماده ای خارجی محسوب می شود. این ترکیبات اغلب سنتزی بوده و ورود آنها به طبیعتدارای مخاطرات بسیاری می باشد؛ این ترکیبات قادر به ورود به درون سلول های زنده بوده ونیز می توانند منجر به بروزاختلالاتی در عملکردهای سلولی گردند. خوشبختانه طبیعت همراه با سیر تکاملی بشر در حال تکامل و بازسازی بوده ومیکروارگانیسم هایی را حمایت می کند که توانایی تجزیه ترکیبات غیر طبیعی و مضر را دشته و در بازسازی طبیعی کمککننده می باشند.هدف از انجام این مطالعه بررسی ترکیب جامعه میکروارگانیسم های موجود در نمونه های خاک یکی از جزایرصخره ای دریاچه بسیار شور ارومیه و همچنین بررسی احتمال وجود ژنوم مربوط به آنزیم های تجزیه کننده زنوبیوتیک هادر چنین اکولوژی بکر و افراطی می باشد.در این مطالعه ابتدا با بکارگیری یکی از روش های NGS ، بنام Miseq illumina و نرم افزار های FLASH وUPARSE به بررسی ژنوم میکروارگانیسم ها و همانندی آنها با استفاده از پایگاه های داده ای پرداخته شد. سپس جهتبررسی وجود آنزیم های تجزیه کننده زنوبیوتیک ها، از نرم افزار PICRUSt و با استفاده از پایگاه داده ای Kegg پرداختهایم. نتایج حاکی از وجود باکتری های معتدل و تحمل کننده سطوح متوسطی از نمک و شوری می باشد؛ همچنین باکتریهای دارای آنزیم های تجزیه کننده ترکیبات زنوبیوتیکی در خاک این منطقه اکولوژیکی افراطی نیز شناسایی شدند.

کلیدواژه ها:

آنزیم ، باکتری خاکزی ، زنوبیوتیک- NGS