بررسی کدون های ترجیحی در قارچ خوراکی دکمه ای سفید

هجده عدد از بیست اسید آمینه حداقل دو یا تعداد بیشتری کدون هم معنی دارند ولی کدو نهای هم معنی به طور یکسانی در ژنوم مورد استفاده قرار نمی گیرند. به کدون هایی که توسط ژ نهای با بیان بالا استفاده می شود ، کدون ترجیحی م یگویند. استفاده ترجیحی از کدون های هم معنی در هر سه سلسله موجودات زنده گزارش شده اند. در درون یک ژنوم، ژن هایی که بیان بالاتری دارند نسبت به ژن هایی که بیان کند تری دارند، استفاده ترجیحی از کدون شدید تر می باشد. بهینه کردن کد ژنتیکی برای بیان بهتر ژن خارجی اهمیت خاصی دارد. هرگاه غلظت یک تی آر ان آی حامل اسی دآمینه خاص در سیتوپلاسم سلول بیشتر باشد، سرعت پروتئین سازی افزایش خواهد یافت. با بررسی 13 عدد از ژن های ثبت شده در پایگاه داده NCBI به همراه پروتئین هایشان در پایگاه داده Uniprot برای قارچ دکمه ای سفید در سطح کلی و در سطح اندام میوه دهی و میسلیوم رویشی، اقدام به بررسی کدون های ترجیحی گردید. در سطح کلی برخی از کدو نهای هم معنی از نظر استفاده ترجیحی تفاوت معنی داری نشان دادند 5% = α . در سطح بافت پدیده کدون ترجیحی معنی داری مشاهده نشد.

کلیدواژه ها:

کدون ترجیحی ، قارچ خوراکی دکمه ای سفید ، اسید آمینه