استفاده از رگرسیون برای بررسی ارتباط نشانگرهای مولکولی SCoT با صفات زراعی و فیزیولوژیک ریحان تحت شرایط تنش خشکی

سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 32

فایل این مقاله در 26 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-16-2_002

تاریخ نمایه سازی: 12 تیر 1403

چکیده مقاله:

هدف: ریحان (Ocimum basilicum) یکی از گیاهان دارویی و سبزی بسیار مهم است که در سطح جهان کشت و مصرف می شود. یکی از جنبه های ضروری برنامه های اصلاح نباتات مطالعه همبستگی بین چندشکلی DNA و تنوع صفات فنوتیپی است. هدف از این تحقیق بررسی تنوع ژنتیکی پنج رقم ریحان در شرایط تنش خشکی با استفاده از نشانگر SCoT و صفات و همچنین انجام تجزیه و تحلیل ارتباط بین صفات و نشانگرها با رگرسیون گام به گام است. مواد و روش ها: در این پژوهش، پنج ژنوتیپ ریحان تحت شرایط تنش خشکی به صورت طرح اسپیلت پلات بر پایه طرح کاملا تصادفی با سه تکرار در گلدان و در شرایط گلخانه ای مورد مطالعه قرار گرفتند. فاکتور اصلی شامل تنش خشکی در دو سطح (نرمال و تنش خشکی) و عامل فرعی شامل ژنوتیپ (۵ سطح) بود و صفات ریخت شناسی و فیزیولوژیک آن ها ارزیابی گردیدند. همچنین DNA ژنومی آن ها از برگ استخراج گردید و تنوع ژنوتیپی ژنوتیپ ها بر اساس هشت آغازگر SCoT بررسی شد و در نهایت ارتباط بین صفات و نشانگرها با رگرسیون گام به گام مشخص گردید.نتایج: همبستگی صفات در دو شرایط نشان داد که عملکرد برگ همبستگی مثبت و معنی داری با صفات صفات ارتفاع بوته و کلروفیل کل داشت. درصد تغییرات صفات در شرایط تنش نشان داد که صفات طول ریشه، کلروفیل a و کلروفیل کل بیشترین کاهش را داشتند و تجزیه خوشه ای براساس آنها، ژنوتیپ ها را در سه گروه و صفات را نیز در سه گروه قرار داد. هشت آغازگر در مجموع تعداد ۱۰۱ نوار چندشکل تکثیر کردند و ScoT۱ با ۱۷ نوار چندشکل، بیشترین نوار رو تولید کرد. تجزیه خوشه ای به روش جفت گروه بدون وزن با میانگین حسابی و معیار شباهت دایس بر اساس داده های SCoT، پنج ژنوتیپ ریحان را در سه گروه قرار دادند. نتایج تجزیه رگرسیون نشان داد که به ترتیب در شرایط نرمال و تنش خشکی، ۱۵ و ۱۲ نشانگر (آلل) با صفات مورد مطالعه رابطه معنی داری پیدا کردند.نتیجه گیری: انتخاب بر اساس نشانگرهای مولکولی روشی سریع برای برنامه های اصلاحی ارائه می دهد. اطلاعات ژنتیکی به دست آمده نشانگرها در این مطالعه نقش مهم آنها را نشان داد. بنابراین در کنار صفات، انتخاب ژنوتیپ های برتر و جمعیت های با ارزش بالا در برنامه های اصلاحی امکان پذیر است. یافته ها نشان داد که نشانگرهای خاصی با صفات متعدد مرتبط هستند و بر اهمیت حیاتی این ویژگی در اصلاح گیاهان برای بهبود همزمان صفات متعدد تاکید کرد. بینش این مطالعه در مورد نشانگرها دارای پتانسیل برای کاربرد در برنامه های به نژادی است.

نویسندگان

آتوسا کشاورزی

گروه بیوتکنولوژی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان، ایران.

مهدی رحیمی

دانشیار، گروه بیوتکنولوژی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان، ایران

امین باقی زاده

دانشیار، گروه بیوتکنولوژی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • افکاری احمد (۱۳۹۶) تاثیر تنش خشکی و مقادیر کود نیتروژنه ...
  • کریمی سمیه، زاهدی بهمن، مومیوند حسن (۱۳۹۹) بررسی تاثیر تنش ...
  • ReferencesAbdoliNasab M, Rahimi M (۲۰۲۰) Association analysis of traits in ...
  • Abecasis GR, Cardon LR, Cookson WO et al. (۲۰۰۱) Association ...
  • Abuhashem YS, Khalil HB, El-Tahawey MA et al. (۲۰۲۳) Exploring ...
  • Afkari A (۲۰۱۸) Effects of drought stress and nitrogen fertilizer ...
  • Aghaei M, Darvishzadeh R, Hassani A (۲۰۱۲) Molecular characterisation and ...
  • Al-Ashkar I, Alderfasi A, Ben Romdhane W et al. (۲۰۲۰) ...
  • Arabsalehi F, Rahimmalek M, Sabzalian MR (۲۰۲۲) Morpho-physiological and molecular ...
  • Asghari J, Mahdavikia H, Rezaei-Chiyaneh E et al. (۲۰۲۳) Selenium ...
  • Azizi A, Ardalani H, Honermeier B (۲۰۱۶) Statistical analysis of ...
  • Bates LS, Waldren Ra, Teare I (۱۹۷۳) Rapid determination of ...
  • Begna T (۲۰۲۱) Role and economic importance of crop genetic ...
  • Bhandari H, Bhanu A, Srivastava K et al. (۲۰۱۷) Assessment ...
  • Botstein D, White RL, Skolnick M et al. (۱۹۸۰) Construction ...
  • Collard BC, Mackill DJ (۲۰۰۹) Start codon targeted (SCoT) polymorphism: ...
  • De Masi L, Siviero P, Esposito C et al. (۲۰۰۶) ...
  • Doyle J (۱۹۹۱) DNA protocols for plants. In: Molecular techniques ...
  • Esposito MA, Gatti I, Cravero VP et al. (۲۰۱۳) Combining ...
  • Farhangian-Kashani S, Azadi A, Khaghani S et al. (۲۰۲۱) Association ...
  • Gebhardt C, Ballvora A, Walkemeier B et al. (۲۰۰۴) Assessing ...
  • Giachino RRA, Sönmez Ç, Tonk FA et al. (۲۰۱۴) RAPD ...
  • Golkar P, Nourbakhsh V (۲۰۱۹) Analysis of genetic diversity and ...
  • Gonda I, Faigenboim A, Adler C et al. (۲۰۲۰) The ...
  • Hamidi M, Tohidi Moghadam H, Nasri M et al. (۲۰۲۳) ...
  • Hammer Ø, Harper D, Ryan P (۲۰۰۱) PAST: Paleontological statistics ...
  • Henry RJ (۲۰۱۲) Molecular markers in plants. Wiley, USA ...
  • Jambhale V, Awari V, Aher A et al. (۲۰۲۳) Assessment ...
  • Javanmardi J, Khalighi A, Kashi A et al. (۲۰۰۲) Chemical ...
  • Kafi MA, Mahdavi Damghani M (۲۰۰۳) Mechanisms of Environmental Stress ...
  • Karimi S, Zahedi B, Mumivand H (۲۰۲۰) Evaluation of the ...
  • Khadka K, Earl HJ, Raizada MN et al. (۲۰۲۰) A ...
  • Khalid KA (۲۰۰۶) Influence of water stress on growth, essential ...
  • Kordrostami M, Rahimi M (۲۰۱۵) Molecular markers in plants: concepts ...
  • Kumar RR, Reddy LPA, Patel RP (۲۰۱۲) Genetic association for ...
  • Labra M, Miele M, Ledda B et al. (۲۰۰۴) Morphological ...
  • Lambert SM, Borba EL, Machado MC et al. (۲۰۰۶) Allozyme ...
  • Lee S-J, Umano K, Shibamoto T et al. (۲۰۰۵) Identification ...
  • Lichtenthaler HK (۱۹۸۷) [۳۴] Chlorophylls and carotenoids: pigments of photosynthetic ...
  • Liu BH (۱۹۹۸) Statistical genomics: Linkage, mapping and QTL analysis. ...
  • Louwaars NP (۲۰۱۸) Plant breeding and diversity: A troubled relationship? ...
  • Luo C, He X-H, Chen H et al. (۲۰۱۰) Analysis ...
  • Luo C, He X-h, Chen H et al. (۲۰۱۱) Genetic ...
  • Luo Z, Chen Z, Liu M et al. (۲۰۲۲) Phenotypic, ...
  • Mandel JR, Nambeesan S, Bowers JE et al. (۲۰۱۳) Association ...
  • Moghaddam M, Omidbeygi R, Salimi A et al. (۲۰۱۴) An ...
  • Nei M (۱۹۷۲) Genetic distance between populations. Am Nat ۱۰۶, ...
  • Pandey Y, Chaturvedi T, Swaroop H et al. (۲۰۲۳) Phytochemical ...
  • Patel RP, Singh R, Lal RK et al. (۲۰۱۸) Genetic ...
  • Pathirana R, Carimi F (۲۰۲۲) Management and utilization of plant ...
  • Pawlak K, Kołodziejczak M (۲۰۲۰) The role of agriculture in ...
  • Powell W, Morgante M, Andre C et al. (۱۹۹۶) The ...
  • Pritchard JK, Stephens M, Rosenberg NA et al. (۲۰۰۰) Association ...
  • Rahimi M (۲۰۲۱) Genetic diversity, population structure and screening of ...
  • Rahimi M, Kordrostami M, SafaeiChaeikar S (۲۰۱۹) Genetic variation, population ...
  • Rahimi M, Nazari L, Kordrostami M et al. (۲۰۱۸) SCoT ...
  • Rahimi M, Ranjbaran E (۲۰۲۳) Investigating the geographical, phenotypic and ...
  • Reynolds M, Chapman S, Crespo-Herrera L et al. (۲۰۲۰) Breeder ...
  • Sawant SV, Singh PK, Gupta SK et al. (۱۹۹۹) Conserved ...
  • Shannon CE (۲۰۰۱) A mathematical theory of communication. ACM SIGMOBILE ...
  • Sheller M, Tóth EG, Ciocîrlan E et al. (۲۰۲۳) Genetic ...
  • Singh Y, Gaurav S, Kumar P et al. (۲۰۱۵) Genetic ...
  • Stankovic S, Zdravkovic-Korac S, Vujicic M, Jevremovic, S et al. ...
  • Tessier C, David J, This P et al. (۱۹۹۹) Optimization ...
  • Wang Z, Li G, Sun H et al. (۲۰۱۸) Effects ...
  • Wei T, Simko V, Levy M et al. (۲۰۱۷) Package ...
  • Yaldiz G, Camlica M (۲۰۲۱) Agro‐morphological and phenotypic variability of ...
  • Yeh FC (۱۹۹۹) POPGENE (version ۱.۳. ۱). Microsoft Window-Bases Freeware ...
  • نمایش کامل مراجع