ردیابی و بررسی جایگاه تبارزایی ویروس پنهان زعفران Saffron latent virus در مزارع زعفران استان های خراسان جنوبی و رضوی

ویروس پنهان زعفران (Saffron Latent Virus, SaLV)، یک گونه جدید از جنس Potyvirus است که به تازگی در ایران شناسایی شده است. علی رغم اینکه بسیاری از علایم این ویروس مخفی می باشد، اما خسارت آن در مزارع زعفران قابل ملاحظه است. علیرغم شناسایی این ویروس، تاکنون بررسی تبارزایی جدایه ­های آن بر مبنای پروتئین پوششی صورت نگرفته است. برای بررسی این ویروس تعداد ۱۵۲ نمونه از برگ، گل  و بنه زعفران های بدون علایم و دارای علایم کوتولگی، زردی و پیچیدگی از مزارع استان های خراسان جنوبی و رضوی، جمع آوری گردید. پس از استخراج RNA ، با استفاده از واکنش زنجیره ای پلی­مراز معکوس (RT-PCR) و آغازگرهای اختصاصی مربوط به پروتئین پوششی، حضور SaLV مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد تعداد ۹۲ نمونه از ۱۵۲ نمونه (معادل ۶۰%) آلوده به ویروس بودند. در نهایت هفت نمونه به عنوان نمونه­ هایی که برمبنای شهرستان محل نمونه­ برداری از ۹۲ نمونه تکثیر شده در آزمون زنجیره­ای پلی­مراز، انتخاب شده بودند مورد توالی­ یابی قرار گرفتند. بررسی­ های تبارزایی، بر پایه پروتئین پوششی و با نرم افزار MEGAX، نشان داد که جدایه ­های این ویروس دو گروه مجزا تشکیل دادند، که جدایه های مورد مطالعه در این تحقیق در گروه دوم قرار گرفتند. از آنجائیکه جدایه های مربوط به یک منطقه و یک محصول در گروه های مختلف پخش شده، بنابراین منطقه جغرافیایی جداسازی و نوع میزبان در تبارزایی ویروس تاثیر گذار نمی ­باشد. تحقیق حاضر برای اولین بار به ردیابی ویروس از روی گل و بنه زعفران و نیز بررسی تبارزایی جدایه­ های این ویروس جدید بر مبنای پروتئین پوششی در ایران می ­پردازد.

کلیدواژه ها:

آغازگر اختصاصی ، پروتئین پوششی ، تبارزایی ، تعیین توالی