بر اساس سامانه ارزیابی کمیسیون نشریات علمی کشور، نشریه پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی رتبه "ب" را کسب نموده است.
نشریه علمی- پژوهشی "پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی" مقاله های تحقیقی و اصیل در تمامی زمینه های علوم گیاهپزشکی و موضوعات مرتبط با آن را در قالب مقاله کامل پژوهشی، مقاله کوتاه، گزارش علمی کوتاه پذیرش و چاپ می کند.
محورهای اصلی پذیرش مقاله:
مدیریت بیماری های گیاهی
مدیریت آفات گیاهی
مدیریت علف های هرز (با تاکید بر کنترل شیمیایی و زیستی)
حفاظت گیاهان
تشخیص عوامل بیماری زای گیاهی (قارچ ها، پروکاریوت ها، ویروس ها، نماتودها، گیاهان عالی انگل و ...).
کنترل زیستی عوامل بیماری زا گیاهی، آفات گیاهی و علف های هرز
مدیریت تلفیقی آفات (شامل مهره‌داران، بی‌مهرگان، میکروارگانیسم‌ها و علف‌های هرز)
زیست‌شناسی، رفتارشناسی، ژنتیک، بیوشیمی، سیستماتیک، فیزیولژی و اکولژی آفات و عوامل مفید
عوامل تنش‌زای غیرزنده در گیاهپزشکی
تنوع زیستی و برهم‌کنش‌ها در گیاهپزشکی
روابط متقابل گیاهان، آفات و دشمنان طبیعی
کنترل بیولژیک و میکروبیولژیک، امنیت غذایی و گیاهپزشکی
فناوری‌های نوین در مدیریت آفات
کاربرد آفتکش‌ها و اثرات زیست محیطی آنها
گیاهپزشکی و کشاورزی پایدار
اثرات اقتصادی و اجتماعی مدیریت آفات
گیاهپزشکی و کشاورزی دقیق