شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون (JD) در نژادهای بز
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 159
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JASR-15-3_011
تاریخ نمایه سازی: 16 مهر 1402
چکیده مقاله:
پاراتوبرکلوزیس یا بیماری یون (JD) یکی از بیماریهای مهم مزمن التهاب رودهای در نشخوارکنندگان است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی نشانههای انتخاب با استفاده از آماره نااریب تتا مرتبط با مقاومت به بیماری یون در دو نژاد بز جانیکا و سیریانا میباشد. به این منظور، مجموع ۳۳۱ حیوان برای ۵۳۳۴۵ جایگاه نشانگری SNP با استفاده از تراشههای Caprine SNP۵۰ BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت دادههای اولیه در نهایت، ۵۱۱۸۲ نشانگر SNP و ۳۲۶ راس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده بر اساس آزمون آنتیبادی سرم خون (الایزا) در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم (۱۶۲) و بیمار (۱۶۴) گروهبندی شدند. با در نظر گرفتن صدک ۹/۹۹ کل ارزشهای تتا، سیزده ناحیه ژنومی در نژاد جانیکا روی کروموزومهای ۱، ۵، ۷ (دو منطقه)، ۸، ۹ (دو منطقه)، ۱۱، ۱۶، ۱۷، ۱۸ و ۲۰ (دو منطقه) شناسایی شدند. همچنین، در نژاد سیریانا نواحی ژنومی روی کروموزومهای ۳، ۵ (دو منطقه)، ۱۰، ۱۲، ۱۶، ۱۷، ۱۸، ۲۳، ۲۴ و ۲۹ بالاتر از این دامنه بودند، شناسایی شدند. بررسی ژنهای گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژنهای IL۴، IL۱۳، TLR۲، TLR۴، IFNGR۱، PGLYRP۱، CHI۳L۲، PPFIBP۱ و DENND۵B قرار داشتند. بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد، ژنهای موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، مقاومت به بیماری و عفونت باکتریایی، پاسخ به استرس اکسیداتیو و سرکوب سرطان مرتبط هستند. نتایج این تحقیق میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه، ژنهای مرتبط با بیماری یون در نژادهای مختلف بز فراهم آورد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
حسین محمدی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک، اراک، ایران
محمد شمس اللهی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :