بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های انجیر منطقه استهبان بر اساس صفات ریخت شناسی و نشانگرهای مولکولی SCoT

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 153

فایل این مقاله در 24 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-14-4_003

تاریخ نمایه سازی: 16 بهمن 1401

چکیده مقاله:

هدف: انجیر (Ficus carica) یک درخت خزان کننده می باشد که در مناطق خشک و نیمه خشک کشت می شود. انجیر به عنوان یک محصول مهم، در چند دهه اخیر به دلیل بروز تنش های زنده و غیرزنده دچار فرسایش ژنتیکی شده است. هدف از این تحقیق تعیین تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های موجود در استهبان با استفاده از صفات ریخت شناسی و نشانگر مولکولی Start Codon Targeted (SCoT) است. مواد و روش ها: در این پژوهش، تعداد ۱۶ ژنوتیپ انجیر در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار از لحاظ صفات ریخت شناسی آن ها ارزیابی گردیدند. همچنین DNA ژنومی آن ها از برگ استخراج گردید و تنوع ژنوتیپی ژنوتیپ ها بر اساس ۱۰ آغازگر SCoT بررسی شد. نتایج: تجزیه واریانس تفاوت معنی داری بین صفات نشان داد و همچنین تجزیه خوشه ای بر اساس صفات ریخت شناسی، ژنوتیپ ها را در پنج گروه قرار داد. هشت آغازگر در مجموع تعداد ۵۰ نوار چندشکل تکثیر کردند و SCoT۱۲ و SCoT۱۱ به ترتیب با ۱۳ و ۹ نوار چندشکل، بیشترین نوار رو تولید کردند. محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) برای نشانگر SCoT بین ۳۴۲۳/۰ تا ۳۷۹۱/۰ با میانگین ۳۵۹۵/۰ متغیر بود. تجزیه خوشه ای به روش جفت گروه بدون وزن با میانگین حسابی و معیار شباهت گاور بر اساس داده های SCoT، ۱۶ ژنوتیپ انجیر را در چهار گروه قرار دادند. گروه بندی بر اساس روش بیزی ژنوتیپ ها را در نه گروه قرار داد اگرچه ژنوتیپ ها تمایز نداشتند و مخلوطی از هر نه گروه بودند. نتیجه گیری: نتایج حاکی از آن است که کاربرد نشانگر SCoT دارای مزیت بالایی بوده و نقش بسزایی در تفکیک و تمایز ژنوتیپ های انجیر دارد نشانگر مولکولی SCoT و صفات ریخت شناسی تنوع بالایی را میان ژنوتیپ ها نشان داده اند. نتایج به دست آمده از این پژوهش نشان دهنده وجود تنوع ژنتیکی بالا در خزانه ژنتیکی ارقام انجیر استهبان هست که با حفاظت از این منبع غنی می توان از آن ها در اجرای برنامه های به نژادی بهره برد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

الهه رنجبران

دانشگاه تحصیلات تکمیلی کرمان

مهدی رحیمی

کرمان کرمان- انتهای بلوار هفت باغ علوی- دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته- پژوهشکده علوم محیطی- گروه بیوتکنولوژی

مریم عبدلی نسب

دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته کرمان-گروه بیوتکنولوژی

، حمید زارع

ایستگاه تحقیقات انجیر، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی فارس، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، استهبان، ایران.

مجتبی کردرستمی

گروه اصلاح نباتات، پژوهشکده کشاورزی هسته ای، پژوهشگاه علوم و فنون هسته ای، سازمان انرژی اتمی، کرج، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • عسکری ناهید، باقی زاده امین، محمدآبادی محمدرضا (۱۳۸۹). مطالعه تنوع ...
  • محمدی فر آمنه، فقیه ایمانی سیدعلی، محمدآبادی محمدرضا، سفلایی محمد ...
  • محمدی فر آمنه، محمدآبادی محمدرضا (۱۳۹۰). کاربرد نشانگرهای ریزماهواره برای ...
  • ReferencesAbdelsalam NR, Awad RM, Ali HM et al. (۲۰۱۹) Morphological, ...
  • Akbulut M, Ercisli S, Karlidag H (۲۰۰۹) RAPD-based study of ...
  • Ali-Shtayeh MS, Jamous RM, Zaitoun SYA et al. (۲۰۱۴) Genetic ...
  • Amiryousefi A, Hyvönen J, Poczai P (۲۰۱۸) iMEC: Online marker ...
  • Aradhya MK, Stover E, Velasco D et al. (۲۰۱۰) Genetic ...
  • Arnon DI (۱۹۴۹) Copper enzymes in isolated chloroplasts. Polyphenoloxidase in ...
  • Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi M (۲۰۰۸) Analysis of the ...
  • Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (۲۰۱۰) Study of genetic ...
  • Beck N, Lord E (۱۹۸۸) Breeding system in Ficus carica, ...
  • Behera TK, Gaikward AB, Singh AK et al. (۲۰۰۸) Relative ...
  • Benettayeb Z, Bencheikh M, Setti B et al. (۲۰۱۷) Genetic ...
  • Botstein D, White RL, Skolnick M et al. (۱۹۸۰) Construction ...
  • Chatti K, Baraket G, Abdelkrim AB et al. (۲۰۱۰) Development ...
  • Dalklccedil Z, Mestav HO, Kocata H (۲۰۱۱) Genetic diversity of ...
  • Datwyler SL, Weiblen GD (۲۰۰۴) On the origin of the ...
  • De Masi L, Castaldo D, Galano G et al. (۲۰۰۵) ...
  • Dellaporta SL, Wood J, Hicks JB (۱۹۸۳) A plant DNA ...
  • Doolatian L, Khodayari H, Mohammadi A (۲۰۱۷) The genetic diversity ...
  • Earl DA, vonHoldt BM (۲۰۱۲) STRUCTURE HARVESTER: a website and ...
  • Evanno G, Regnaut S, Goudet J (۲۰۰۵) Detecting the number ...
  • FAOSTAT (۲۰۲۰) Statistical databases. In: Food and Agriculture Organization of ...
  • Fateh A, Ali F (۲۰۱۰) Assessment of genetic diversity among ...
  • Ganopoulos I, Kalivas A, Kavroulakis N et al. (۲۰۱۵) Genetic ...
  • Ghasemi M, Baghizadeh A, Abadi M (۲۰۱۰) Determination of genetic ...
  • Gheitarani B, Erfani-Moghadam J, Fazeli A (۲۰۲۰) Evaluation of genetic ...
  • Ghorbani A, Hasanpour H, Ercisli S (۲۰۱۹) Variation on biochemical, ...
  • Golkar P, Mokhtari N (۲۰۱۸) Molecular diversity assessment of a ...
  • Hadia HA, El-Mokadem HE, El-Tayeb H (۲۰۰۸) Phylogenetic relationship of ...
  • Hammer Ø, Harper D, Ryan P (۲۰۰۱) PAST: Paleontological statistics ...
  • Hoehn E, Gasser F, Guggenbühl B et al. (۲۰۰۳) Efficacy ...
  • Hssaini L, Hanine H, Razouk R et al. (۲۰۲۰) Assessment ...
  • Ikegami H, Nogata H, Hirashima K et al. (۲۰۰۹) Analysis ...
  • Jiang L, Shen Z, Zheng H et al. (۲۰۱۳) Noninvasive ...
  • Khadari B, Lashermes P, Kjellberg F (۱۹۹۵) RAPD fingerprints for ...
  • Kumar H (۱۹۹۱) Cytogenetics of safflower. In: Developments in Plant ...
  • Li J, Pei G, Pang H et al. (۲۰۰۶) A ...
  • Liu BH (۱۹۹۸) Statistical genomics: Linkage, mapping and QTL analysis. ...
  • Luo C, He X-h, Chen H et al. (۲۰۱۱) Genetic ...
  • Mohammadabadi M (۲۰۱۷) Inter-simple sequence repeat loci associations with predicted ...
  • Mohammadabadi M, Bordbar F, Jensen J et al. (۲۰۲۱) Key ...
  • Mohammadabadi M, Esfandyarpoor E, Mousapour A (۲۰۱۷) Using inter simple ...
  • Mohammadifar A, Faqih Imani SA, Mohammad Abadi MR et al. ...
  • Mohammadifar A, Mohammadabadi M (۲۰۱۲) Application of microsatellite markers for ...
  • Mohammadifar A, Mohammadabadi M (۲۰۱۸) Melanocortin-۳ receptor (mc۳r) gene association ...
  • Nadeem MA, Nawaz MA, Shahid MQ et al. (۲۰۱۸) DNA ...
  • Nei M (۱۹۷۲) Genetic distance between populations. The American Naturalist ...
  • Piya S, Nepal MP, Butler JL et al. (۲۰۱۴) Genetic ...
  • Powell W, Morgante M, Andre C et al. (۱۹۹۶) The ...
  • Price A, Hendry G (۱۹۹۱) Iron‐catalysed oxygen radical formation and ...
  • Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (۲۰۰۰) Inference of population ...
  • Rout GR, Aparajita S (۲۰۰۹) Genetic relationships among ۲۳ Ficus ...
  • Sadder M, Ateyyeh A (۲۰۰۶) Molecular assessment of polymorphism among ...
  • Saddoud O, Chatti K, Salhi‐Hannachi A et al. (۲۰۰۷) Genetic ...
  • Saddoud O, Salhi-Hannachi A, Chatti K et al. (۲۰۰۵) Tunisian ...
  • Shannon CE (۲۰۰۱) A mathematical theory of communication. ACM SIGMOBILE ...
  • Talebi R, Nosrati S, Etminan A et al. (۲۰۱۸) Genetic ...
  • Teoman S, Meryem I, Erturk U et al. (۲۰۱۷) Assessment ...
  • Tessier C, David J, This P et al. (۱۹۹۹) Optimization ...
  • Yeh FC (۱۹۹۹) POPGENE (version ۱.۳. ۱). Microsoft Window-Bases Freeware ...
  • Zeynel D, Gonca G, nver-Dalklccedil et al. (۲۰۱۱) Genetic diversity ...
  • نمایش کامل مراجع