ویرایش ژن MALAT۱ در رده سلولی سرطان سینه MDA-MB-۳۶۱ با روش نوین کریسپر

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 439

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_SHIMU-30-2_003

تاریخ نمایه سازی: 16 خرداد 1401

چکیده مقاله:

مقدمه: RNAهای غیرکدکننده بلند به طور فعال نقش مهمی در تنظیم بیان ژن، پردازش RNA، اصلاح هیستون و بازآرایی ژن های کروماتین ایفا می کنند؛ همچنین این مولکول ها می توانند در فرایند های زیست شناختی متنوع ازجمله اندام زایی، تمایز سلولی، نمو طبیعی، نقش پذیری ژنوم، جبران مقدار و روند تومورزایی دخیل باشند. بیان بالای MALAT۱ (نوعی lncRNA) در بسیاری از سرطان ها، ازجمله سرطان سینه نشان می­دهد که اختلال تنظیم MALAT۱ در رشد بسیاری از انواع سرطان ها عامل مهمی به شمار می رود. سرطان سینه شایع ترین سرطان در میان زنان در سراسر جهان است و تهاجم و متاستاز این بیماری از علل اصلی مرگ ومیر مرتبط با آن است. هدف از مطالعه حاضر، حذف ژن MALAT۱ در رده سلولی MDA-MB-۳۶۱ سرطان سینه و ارزیابی عملکرد و تاثیرات آن روی بیان ژن های مرتبط با آپوپتوز است. مواد و روش ها: در این مطالعه، دو نوع sgRNA توسط نرم افزار CHOPCHOP برای اگزون شماره ۱ ژن MALAT۱ طراحی شد. این sgRNAها در دو وکتور کریسپری به صورت جداگانه کلون گردیدند تا وکتورهای نوترکیب PX۴۵۹-sgRNA۱ و PX۴۵۹-sgRNA۲ به وجود آیند. انتقال همزمان این دو وکتور به رده سلول های سرطانی MDA-MB-۳۶۱ با استفاده از لیپوفکتامین ۲۰۰۰ صورت گرفت. ویرایش ژن MALAT۱ در سلول های دریافت کننده وکتورهای کریسپری بررسی شد. میزان بیان ژن های مرتبط با آپوپتوز به روش real time PCR آنالیز گردید. میزان تکثیر سلولی و آپوپتوز به ترتیب با روش های MTT و فلوسیتومتری ارزیابی شد. یافته ها: ویرایش ژن MALAT۱ به روش کریسپر در سلول های MDA-MB-۳۶۱ صورت گرفت. میزان تکثیر سلولی در سلول های گروه تیمار نسبت به گروه های کنترل، کاهش معنی داری نشان داد (P˂۰.۰۵). سطح آپوپتوز در سلول های سرطانی که ژن MALAT۱ آن ها حذف گردیده است، با افزایش چشمگیری همراه بود؛ همچنین بیان ژن های آنتی آپوپتوزی BCL۲ و survivin در سلول های تحت تیمار (ویرایش شده) نسبت به سلول های گروه کنترل، به صورت معنا داری کاهش یافت (P˂۰.۰۵). افزایش بیان ژن های پروآپوپتوزی P۵۳، BAK، BAX و FAS نیز در سلول های ویرایش شده مشاهده گردید (P˂۰.۰۵). بحث و نتیجه گیری: نتایج این مطالعه تایید می کند که حذف ژن MALAT۱ در افزایش آپوپتوز و کاهش تکثیر سلولی تاثیر بسزایی دارد و کاهش بیان ژن MALAT۱ می تواند از رشد و تکثیر رده سلول سرطان سینه جلوگیری کند؛ بنابراین، به نظر می رسد کنترل بیان انکوژن MALAT۱ برای کنترل تومورها مفید و موثر است.  

کلیدواژه ها:

Apoptosis ، Breast cancer cell line ، CRISPR ، MALAT۱ ، MALAT۱ ، رده سلولی سرطان سینه ، کریسپر ، آپوپتوز

نویسندگان

ثریا احمدی بلوطکی

Dept of Genetic, Faculty of Basic Sciences, Marvdasht Branch, Islamic Azad University, Marvdasht, Iran

عباس دوستی

Biotechnology Research Center, Shahrekord Branch, Islamic Azad University, Shahrekord, Iran

مجتبی جعفری نیا

Dept of Biology, Marvdasht Branch, Islamic Azad University, Marvdasht, Iran

حامدرضا گودرزی

Dept of Genetic, Faculty of Basic Sciences, Marvdasht Branch, Islamic Azad University, Marvdasht, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Zahedi R, Molavivardanjani H, Baneshi MR, Haghdoost AA, Malekpourafshar R. ...
  • Farhood B, Geraily G, Alizadeh A. Incidence and mortality of ...
  • Ghafourifard S, Tamizkar KH, Hussen BM, Taheri M. An update ...
  • Li He, Si qing Ma, Jin Huang, Xiao ping Chen, ...
  • Zhou S, He Y, Yang S, Hu J, Zhang Q, ...
  • Dey BK, Mueller AC, Dutta A. Long non coding RNAs ...
  • Zhao M, Wang S, Li Q, Ji Q, Guo P, ...
  • Li X, Chen N, Zhou L, Wang C, Wen X, ...
  • Wang Y, Xue D, Li Y, Pan X, Zhang X, ...
  • Dake C, Xu T, Chang HH, Song Q, Zhu Y, ...
  • Peng R, Luo C, Guo Q, Cao J, Yang Q, ...
  • Shen F, Zheng H, Zhou L, Li W, Xu X. ...
  • Chen Y, Huang W, Sun W, Zheng B, Wang C, ...
  • Sun Z, Ou C, Liu J, Chen C, Zhou Q, ...
  • Ellis MJ, Ding L, Shen D, Luo J, Suman VJ, ...
  • Yoshimoto R, Mayeda A, Yoshida M, Nakagawa S. MALAT۱ long ...
  • Gayatri A, Diermeier S, Akerman M, Chang KC, Wilkinson LE, ...
  • Mendell JT. Targeting a long noncoding RNA in breast cancer. ...
  • Louie E, Chen XF, Coomes A, Ji K, Tsirka S, ...
  • Vijai S, Gohil N, Garcia RR, Braddick D, Fofié CK. ...
  • Carlos PQ, Aparicio-Prat E, Arnan C, Polidori T, Hermoso T, ...
  • Tianzuo Z, Rindtorff N, Betge J, Ebert MP, Boutros M. ...
  • Yuan R, Varanasi M, Mendes S, Yamagata HM, Wilson RD, ...
  • Qiong W, Meng WY, Jie Y, Zhao H. LncRNA MALAT۱ ...
  • Shi D, Zhang Y, Lu R, Zhang Y. The long ...
  • Zhang R, Xia Y, Wang Z, Zheng J, Chen Y, ...
  • Zidan HE, Karam RA, El-Seifi OS, Elrahman TA . Circulating ...
  • Wenjian Y, Bai Y, Li Y, Guo L, Zeng P, ...
  • Quan-jun D, Xie LQ, Li H. Overexpressed MALAT۱ promotes invasion ...
  • Ruilin L, Xue M, Zhang L, Lin ZQ. Long noncoding ...
  • Xie H, Liao X, Chen Z, Fang Y, He A, ...
  • Jijun L, Gao J, Tian W, Li Y, Zhang J. ...
  • Yi H, Lin J, Fang H, Fang J, Li C, ...
  • Chang J, Xu W, Du X, Hou J. MALAT۱ silencing ...
  • Khadijeh Z, Shademan M, Ghahramani Seno MM, Dehghani H. CRISPR/Cas۹ ...
  • Said AH, Boshra MS, El Meteini MS, Shafei AE, Matboli ...
  • Tingting J, Wang F, Qiao B, Ren Y, Xing L, ...
  • Shuai Z, Hua L, Liu YH, Sun XM, Jiang MM, ...
  • Yi-Qiang Z, Pei JH, Shi SS, Guo XS, Cui GY, ...
  • Zahedi R, Molavivardanjani H, Baneshi MR, Haghdoost AA, Malekpourafshar R. ...
  • Farhood B, Geraily G, Alizadeh A. Incidence and mortality of ...
  • Ghafourifard S, Tamizkar KH, Hussen BM, Taheri M. An update ...
  • Li He, Si qing Ma, Jin Huang, Xiao ping Chen, ...
  • Zhou S, He Y, Yang S, Hu J, Zhang Q, ...
  • Dey BK, Mueller AC, Dutta A. Long non coding RNAs ...
  • Zhao M, Wang S, Li Q, Ji Q, Guo P, ...
  • Li X, Chen N, Zhou L, Wang C, Wen X, ...
  • Wang Y, Xue D, Li Y, Pan X, Zhang X, ...
  • Dake C, Xu T, Chang HH, Song Q, Zhu Y, ...
  • Peng R, Luo C, Guo Q, Cao J, Yang Q, ...
  • Shen F, Zheng H, Zhou L, Li W, Xu X. ...
  • Chen Y, Huang W, Sun W, Zheng B, Wang C, ...
  • Sun Z, Ou C, Liu J, Chen C, Zhou Q, ...
  • Ellis MJ, Ding L, Shen D, Luo J, Suman VJ, ...
  • Yoshimoto R, Mayeda A, Yoshida M, Nakagawa S. MALAT۱ long ...
  • Gayatri A, Diermeier S, Akerman M, Chang KC, Wilkinson LE, ...
  • Mendell JT. Targeting a long noncoding RNA in breast cancer. ...
  • Louie E, Chen XF, Coomes A, Ji K, Tsirka S, ...
  • Vijai S, Gohil N, Garcia RR, Braddick D, Fofié CK. ...
  • Carlos PQ, Aparicio-Prat E, Arnan C, Polidori T, Hermoso T, ...
  • Tianzuo Z, Rindtorff N, Betge J, Ebert MP, Boutros M. ...
  • Yuan R, Varanasi M, Mendes S, Yamagata HM, Wilson RD, ...
  • Qiong W, Meng WY, Jie Y, Zhao H. LncRNA MALAT۱ ...
  • Shi D, Zhang Y, Lu R, Zhang Y. The long ...
  • Zhang R, Xia Y, Wang Z, Zheng J, Chen Y, ...
  • Zidan HE, Karam RA, El-Seifi OS, Elrahman TA . Circulating ...
  • Wenjian Y, Bai Y, Li Y, Guo L, Zeng P, ...
  • Quan-jun D, Xie LQ, Li H. Overexpressed MALAT۱ promotes invasion ...
  • Ruilin L, Xue M, Zhang L, Lin ZQ. Long noncoding ...
  • Xie H, Liao X, Chen Z, Fang Y, He A, ...
  • Jijun L, Gao J, Tian W, Li Y, Zhang J. ...
  • Yi H, Lin J, Fang H, Fang J, Li C, ...
  • Chang J, Xu W, Du X, Hou J. MALAT۱ silencing ...
  • Khadijeh Z, Shademan M, Ghahramani Seno MM, Dehghani H. CRISPR/Cas۹ ...
  • Said AH, Boshra MS, El Meteini MS, Shafei AE, Matboli ...
  • Tingting J, Wang F, Qiao B, Ren Y, Xing L, ...
  • Shuai Z, Hua L, Liu YH, Sun XM, Jiang MM, ...
  • Yi-Qiang Z, Pei JH, Shi SS, Guo XS, Cui GY, ...
  • نمایش کامل مراجع