اولین گزارش رخداد ویروس شکست رنگ گل شمعدانی (PFBV) از ایران و تعیین برخی ویژگی های مولکولی آن
محل انتشار: دوفصلنامه گل و گیاهان زینتی، دوره: 6، شماره: 2
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 165
فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_FLOWER-6-2_001
تاریخ نمایه سازی: 17 فروردین 1401
چکیده مقاله:
شمعدانی (Pelargonium spp.)از جایگاه مهمی در صنعت گل و گیاه جهان برخوردار بوده و یکی از محبوب ترین گیاهان برای استفاده داخل و خارج از خانه است. بیماری های ویروسی نقش مهمی در کاهش کمی و کیفی این گیاه زینتی دارند. در این بررسی ۷۲ نمونه مشکوک به آلودگی ویروسی با نشانه هایی مانند لکه های روشن حلقوی، سوخته و زرد روی برگ و شکستگی رنگ گلبرگ و همچنین گیاهان بدون نشانه از گلخانه های مختلف منطقه محلات و ورامین جمع آوری شدند. RNA نمونه های جمع آوری شده استخراج و در آزمون RT-PCR مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از آغازگرهای عمومی تیره Tombusviridae، یک قطعه DNA با اندازه ۵۰۰ جفت باز (bp) از ۲۱ نمونه تکثیر شد. با تعیین توالی قطعه یادشده در دو جدایه ویروس و مقایسه با توالی های موجود در پایگاه داده های GenBank، وابستگی جدایه های یادشده به گونه Pelargonium flower break virus (PFBV) یا ویروس شکست رنگ شمعدانی آشکار شد. دوباره آزمون RT-PCR با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی Ch۱/Ch۲ تکثیر کننده قطعه ای به طول bp۱۵۰۰ از قسمت انتهای ۳' ژنوم PFBV شامل ژن پروتئین پوششی (coat protein, CP) روی نمونه های مورد بررسی انجام گرفت که درستی نتایج مرحله قبل را تایید کرد. قطعه تکثیر شده سه جدایه برگزیده، از ژل استخراج و بهطورمستقیم تعیین توالی شدند. واکاوی فیلوژنتیک براساس توالی آمینواسیدی ژن CP جدایه های برگزیده انجام شد و درختواره فیلوژنی با استفاده از روش neighbor joining رسم گردید. نتایج بررسیهای تبارزایی نشان داد که جدایه های PFBV گزارش شده از کشورهای مختلف در دو گروه قرار می گیرند و سه جدایه PFBV ایران در یک زیر گروه و جدا از زیر گروه های کشورهای دیگر قرار گرفتند. این نخستین گزارش از وجود PFBV از ایران می باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
حسین بیات
Horticulture science research institute-Agriculture research, education and extension organization
مریم کریمی
Horticulture science research institute-Agriculture research, education and extension organization
شیدا بابایی
موسسه تحقیقات علوم باغبانی-سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :