شناسایی ژن های کلیدی پاسخ دهنده به تنش خشکی در واکاوی هم بیانی دادههای ترنسکریپتوم گندم

خشکسالی عمده ترین تنش غیرزیستی و عامل اصلی محدودکننده عملکرد گندم (Triticum aestivum) در سطح جهان است.علیرغم پیشرفت علمی اخیر در رمزگشایی پاسخهای تنش خشکی گندم، تصویر کلی ژن های کلیدی، مسیرها و شبکه های همبیان که تحمل خشکسالی گندم را تنظیم میکند هنوز پراکنده است. بنابراین در این تحقیق، واکاوی داده های ترنسکریپتوم بهمنظور شناسایی مکانیسم های مولکولی تحمل به خشکی گندم انجام شد. تجزیه و تحلیل شبکه بیان ژن وزن دار (WGCNA)امکان توصیف ماژول های ژن های هم بیان را فراهم می کند که ممکن است از نظر عملکرد زیستی همبستگی داشته باشند. براساس نتایج، بسته WGCNA هفت ماژول هم بیان مجزا را شناسایی کرد. همه ماژول ها به طور معناداری با ژن های درگیر درپاسخ به تنش خشکی همبستگی داشتند. واکاوی شبکه ژن منجر به شناسایی ژن های هایی مانند rps۱۵ و rpl۳۳ یا ژنهایی باعملکرد ناشناخته شد که ممکن است در تنظیم مقاومت به خشکی نقش داشته باشد. روی هم رفته، این یافته ها می تواند بهدرک بهتری از تحمل به خشکی منجر شود و پرورش ارقام گندم مقاوم به خشکی را تسهیل کند.

کلیدواژه ها:

تنش خشکی ، داده های ترنسکریپتوم ، گندم ، هم بیانی