شناسایی ژن های میتوکندریایی تاثیر گذار بر تکامل سلول تخم تحت هورمون FSH با استفاده از داده های ریز آرایه در گاو

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 132

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JASR-12-2_001

تاریخ نمایه سازی: 21 اسفند 1400

چکیده مقاله:

بلوغ تخمک شامل بلوغ هسته­ای و سیتوپلاسمی است که هر دو برای لقاح و نمو رویان اهمیت دارد. برخلاف بلوغ هسته­ای، بلوغ سیتوپلاسمی اووسیت را نمی­توان به راحتی ارزیابی کرد. با توجه به توزیع مجدد برخی اندامک­ها از جمله میتوکندری در زمان بلوغ می­توان آن را به عنوان شاخص بلوغ سیتوپلاسمی در نظر گرفت. در این مطالعه به منظور بررسی اثر هورمون FSH در شرایط آزمایشگاهی بر چگونگی بیان ژن­های میتوکندریایی، داده­های ریزآرایه حاوی اطلاعات بیان ژن سلول­های اووسیت گاو، با کد دسترسی GEO ( (GSE۳۸۳۴۵ استفاده گردید. آنالیز و مقایسه بیان ژن­ها در دو حالت قبل و بعد از بلوغ به ترتیب (۲۰ و ۹۶ ساعت بعد از تیمار) با استفاده از لینک نرم­افزاری GEO۲R، دو گروه ژن­های افزایش و کاهش بیان یافته را تعیین نمود. برهمکنش گروه­های ژنی با استفاده از پایگاه اطلاعاتی string، مجسم­سازی شبکه با استفاده از نرم­افزار cytoscape و هستی­شناسی شبکه با استفاده از پایگاه اطلاعاتی comparative GO انجام گردید. در شبکه برهمکنش پروتئینی مربوط به ژن­های افزایش بیان یافته، ژن­های مهمMRPS۱۰ ، MRPS۱۸A، MRPL۱۶ و MRPL۱۷ که در فرایند­های انهدام میتوکندری و ترجمه ژن­های این اندامک و در شبکه ژن­های کاهش بیان یافته، ژن­هایMRPL۲۲،  ATP۵Bو  ATP۵C۱که با کاهش بیان خود، سعی در ایجاد تعادل در مسیر­های مرتبط با انهدام میتوکندری و تولید ATP از طریق نقش در ساختار ATP سنتتاز، داشتند. در این مطالعه ژن­های تنظیم کننده و همچنین مسیر­های بیولوژیکی موثر به منظور درک ساز و کار اثر هورمون FSH بر روند بلوغ اووسیت از طریق اندامک میتوکندری بررسی گردیده است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

گلزار فرهادی

کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان

هدایت الله روشنفکر

دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان

جمال فیاضی

دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان

محمود نظری

دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان

الهام بهدانی

دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alexeyev, M. F., N. Venediktova, V. Pastukh, I. Shokolenko, G. ...
  • Bader, G. D., M. P. Cary, and C. Sander. ۲۰۰۶. ...
  • Bavister, B. D, and J. M. Squirrell. ۲۰۰۰. Mitochondrial distribution ...
  • Behdani, E, and M. R. Bakhtiarizadeh. ۲۰۱۷. Construction of an ...
  • Cantatore, p., Z. Flagella, F. Fracasso, A. M. S. Lezza, ...
  • Campoy, E, and M. I. Colombo. ۲۰۰۹. Autophagy in intracellular ...
  • Chargui, A. ۲۰۱۲. Subversion of autophagy in adherent invasive Escherichia ...
  • Chappel, S. ۲۰۱۳. The Role of Mitochondria from Mature Oocyte ...
  • Chen, X., R. Prosser, S. Simonetti, J. Sadlock, G. Jagiello, ...
  • Endo, T., H. Yamamoto, and M. Esaki. ۲۰۰۳. Functional cooperation ...
  • Feniouk, B. A, and W. Junge. ۲۰۰۵. Regulation of the ...
  • Ferreira, E.M., A. A. Vireque, P. R. Adona, F. V. ...
  • Fleckenstein, B., M. D. Daniel, R. D. Hunt, R. D. ...
  • Ghanem, N., M. Holker, F. Rings, D. Jennen, E. Tholen, ...
  • Gomes, L. C, and I. Dikic. ۲۰۱۴. Autophagy in antimicrobial ...
  • Israel, M. A., H. W. Chan, S. L. Hourihan, W. ...
  • Jansen, R. P, and K. de Boer .۱۹۹۸. The bottleneck: ...
  • Kenmochi, N., T. Suzuki, T. Uechi, M. Magoori, M. Kuniba, ...
  • Krisher, R. L. ۲۰۰۴. The effect of oocyte quality on ...
  • Labrecque, R. M., C .Vigneault, P .Blondin, and M. A. ...
  • Lapaquette, P., P. Brest, P. Hofman, and A. Darfeuille-Michaud . ...
  • Liu, J., L. Jing, and X. TU. ۲۰۱۶. Weighted gene ...
  • Lu, S., J. Arthos, D. C. Montefiori, Y. Yasutomi, K. ...
  • Luo, X., I. Budihardjo, H. Zou, C. Slaughter, and X. ...
  • Nagai, S., T. Mabuchi, S. Hirata, T. Shoda, T. Kasai, ...
  • Nichols, J., B. Zevnik, K. Anastassiadis, H. Niwa, D. Klewe-Nebenius, ...
  • Nicholls, D. G., S. J. Ferguson, and S. Ferguson. ۲۰۰۳. ...
  • Nishi, Y., T. Takeshita, K. Sato, and T. Araki. ۲۰۰۳. ...
  • Nivet, A. L., A. Bunel, R. Labrecque, J. Belanger, C. ...
  • Novak, I. ۲۰۱۲. Mitophagy: a complex mechanism of mitochondrial removal. ...
  • Ohta, S., H. Tomura, K. Matsuda, and Y. Kagawa. ۱۹۸۸. ...
  • Patel, O. V., A. Bettegowda, J. J. Ireland, P. M. ...
  • Peddinti, D., E. Memili, and S. C. Burgess. .۲۰۱۰. Proteomics-Based ...
  • Riquelme Medina, I, and Z .Lubovac-Pilav .۲۰۱۶. Gene Co-Expression Network ...
  • Segal, E., N. Friedman, N. Kaminski, A. Regev, and D. ...
  • Shuster, R. C., A. J. Rubenstein, and D. C. Wallace. ...
  • Springer, M. Z, and K. F. Macleod .۲۰۱۶. Mitophagy: mechanisms ...
  • Stojkovic, M., S. A. Machado, P. Stojkovic, V. Zakhartchenko, P. ...
  • Susin, S. A., N. Zamzami, M. Castedo, T. Hirsch, P. ...
  • Uddin, R. K, and S. M Singh. ۲۰۱۳. Hippocampal gene ...
  • Van Blerkom, J .۱۹۹۱. Microtubule mediation of cytoplasmic and nuclear ...
  • Van Blerkom, J. ۲۰۰۴. “Mitochondria in human oogenesis and preimplantation ...
  • Wallace, D. C. ۲۰۰۱. A mitochondrial paradigm for degenerative diseases ...
  • Wilding, M., B. Dale, M. Marino, L. di Matteo, C. ...
  • Yuk, J. M., T .Yoshimori, and E. K. Jo. ۲۰۱۲. ...
  • Zhang, X., X. Q. Wu, S. Lu, Y. L. Guo, ...
  • نمایش کامل مراجع