مطالعه بیوانفورماتیکی چندجانبه مولکولی و ساختاری پروتئین غشای خارجی (OmpTS) باکتری آئروموناس هیدروفیلاعامل بیماری سپتی سمی عفونی در ماهی در جهت اهداف ایمن سازی
محل انتشار: فصلنامه محیط زیست جانوری، دوره: 8، شماره: 1
سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 202
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_AEJO-8-1_020
تاریخ نمایه سازی: 23 آبان 1400
چکیده مقاله:
باکتری آئروموناس هیدروفیلا یک باکتری گرم منفی و متحرک است که به عنوان یک پاتوژن فرصت طلب و زئونوز در ماهیان گرمابی مطرح است. وقوع میزان بالای مرگ و میر در ماهیان، خسارات اقتصادی و مقاومت باکتریایی از عوامل اصلی پیدایش روش های جدید مانند واکسیناسیون علیه آئروموناس هیدروفیلا محسوب می شوند. با توجه به مطالعات اخیر پروتئین غشای خارجی OmpTS فاکتور حدت باکتری آئروموناس هیدروفیلابوده و نظر به اهمیت سپتی سمی های باکتریایی ناشی از آئروموناس هیدروفیلا بررسی بیوانفورماتیکی و ساختاری این پروتئین در راستای ایمن سازی ماهی ضروری به نظر می رسد. در این مطالعه باکتری آئروموناس هیدروفیلا جدا شده از کلیه تاس ماهی ایرانی (Acipenser persicus) بیمار با استفاده از آزمایش های بیوشیمیایی از جمله اکسیداز، کاتالاز، TSI، SIM، آسکولین، نیترات و هیدرولیز قند ها، مورد بررسی قرار گرفته و یک جفت پرایمر اختصاصی از OmpTS طراحی شده و محصول واکنش زنجیره ای پلیمراز جهت تایید تعیین توالی گردید. به منظور دسترسی به اطلاعات بیش تر در مورد ساختار و خصوصیات این پروتئین درخت تکاملی و ساختار های این پروتئین (اول، دوم و سوم) رسم گردیدند. آزمایش های بیوشیمیایی و تعیین توالی محصول PCR موید باکتری آئروموناس هیدروفیلا جدا شده از کلیه تاس ماهی ایرانی بوده و براساس درخت تکاملی OmpTS باکتری آئروموناس هیدروفیلا بیش ترین شباهت را به A. aquariorum و کم ترین شباهت را به A. diversa دارد. بررسی های ساختاری OmpTS بیان گر پایداری این پروتئین درشرایط آزمایشگاهی می باشد. به علاوه جایگاه های فعال این پروتئین بین اسیدآمینه های ۳۴۰-۱۰۲ می باشد. پیش گیری مناسب برای جلوگیری از وقوع عفونت ها خصوصا عفونت های باکتریایی گرم منفی در صنعت آبزی پروری ضروری بوده از طرفی مطالعه ای در زمینه بیوانفورماتیکی بر روی OmpTS صورت نگرفته ولی با توجه به نتایج حاصل از این مطالعه، پروتئین غشای خارجی OmpTS کاندید مناسبی برای ایمن سازی ماهی علیه آئروموناس هیدروفیلا مطرح است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
شادی افتخارمعنوی
گروه بهداشت و بیماری های آبزیان، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، صندوق پستی: ۱۴۵- ۶۱۳۵۵
رحیم پیغان
گروه بهداشت و بیماری های آبزیان، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، صندوق پستی: ۱۴۵- ۶۱۳۵۵
مهدی سلطانی
گروه بهداشت و بیماری های آبزیان، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران، صندوق پستی: ۱۳۱۸-۱۳۱۴۵
مسعود قربانپورنجفی
گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، صندوق پستی: ۱۴۵- ۶۱۳۵۵
آرش قلیانچی لنگرودی
گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران، صندوق پستی: ۱۳۱۸-۱۳۱۴۵