کاوش ژنومیک تمایز جمعیتی در نژادهای زل و لری بختیاری

انتخاب برای افزایش فراوانی موتاسیون­های جدیدی که فقط در برخی از زیرجمعیت­ها سودمند هستند باعث باقی گذاشتن نشانه­هایی در سطح ژنوم می­شود. شناسایی این مناطق ژنومی یکی از مهمترین حوزه­های تحقیقاتی در ژنتیک حیوانی است، زیرا این مناطق اغلب با QTLهای مرتبط با صفات مهم اقتصادی در ارتباط هستند. در این تحقیق با هدف شناسایی مناطق ژنومی که در دو نژاد گوسفند ایرانی زل و لری-بختیاری هدف انتخاب­های مختلف قرار گرفته­اند، یک کاوش ژنومیک با حدود ۰۰۰,۵۴ مارکر SNP انجام شد. بررسی تمایز جمعیتی با استفاده از روش FST ویر و کوکهام نشان داد که چندین منطقه ژنومی دارای شواهدی از انتخاب در این دو نژاد هستند. در این مقاله ۵ ناحیه ژنومی که در صدک ۹۹/۹۹ کل ارزش­های FST قرار گرفته بودند برای بررسی­های بیشتر انتخاب شدند. این مناطق بر روی کروموزومهای ۲، ۵، ۷ (دو ناحیه) و X واقع شده­اند. برای ارزیابی نشانه­های انتخاب بر پایه روش­های عدم تعادل لینکاژی از آزمون هموزیگوسیتی هاپلوئیدی بسط­داده شده استفاده شد. نتایج این آزمون به همراه بررسی دیاگرام­های شاخه­بندی هاپلوتیپی در این دو نژاد وجود تفرق جمعیتی شدید در این مناطق ژنومی را تایید کرد. در نهایت بررسی QTLهای گزارش شده در مناطق اورتولوگوس گاوی نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با لاشه و تولید مثل همپوشانی دارند. این تحقیق که جزء اولین مراحل توسعه نقشه انتخاب در ژنوم گوسفند محسوب می شود می­تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در راستای شناسایی ژن­های متمایز کننده این دو نژاد فراهم آورد. 

کلیدواژه ها:

: کاوش ژنومیک ، تفرق جمعیتی ، نشانه های انتخاب