ارزیابی نشانگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون ها در شناسایی مکان های مرتبط با عملکرد و برخی صفات گیاهی در ژنوتیپ های کتان ایرانی (Linum usitatissimum L.)

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 198

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJMAPR-36-5_011

تاریخ نمایه سازی: 6 مهر 1400

چکیده مقاله:

شناسه دیجیتال (DOR):۹۸.۱۰۰۰/۱۷۳۵-۰۹۰۵.۱۳۹۹.۳۶.۸۵۱.۱۰۳.۵.۱۵۷۵.۴۱ با توجه به اینکه ارزش اقتصادی یک رقم به صفات مختلف آن بستگی دارد، بنابراین چگونگی اعمال انتخاب برای چندین صفت به منظور حصول حداکثر ارزش اقتصادی همواره مورد نظر به نژادگران بوده است. ازاین رو اطلاع دقیق از رفتار و ارتباط ژنتیکی این صفات به اصلاح ژنوتیپ ها کمک خواهد نمود. در این تحقیق، به منظور شناسایی نشانگرهای مولکولی مرتبط با ۲۱ صفت زراعی، مورفولوژیک و فیزیولوژیک در ۴۵ ژنوتیپ مختلف کتان (Linum usitatissimum L.) براساس مدل خطی مخلوط، از ۳۱ آغازگر مبتنی بر رتروترنسپوزون (۱۲ آغازگر IRAP و ۱۹ آغازگر REMAP) استفاده شد. مطالعه ساختار جمعیت به روش بیزین (Bayesian) نشان داد که دو زیرگروه احتمالی (۲K=) در جمعیت مورد مطالعه وجود دارد. با استفاده از مدل خطی مخلوط در مجموع ۲۹ مکان مرتبط با ۲۱ صفت مورد مطالعه (p ≤۰.۰۱) شناسایی شد. صفات وزن صد دانه و عملکرد دانه بیشترین تعداد مکان پیوسته را به خود اختصاص دادند. وجود نشانگرهای مشترک در میان برخی صفات بررسی شده مانند ارتباط معنی دار نشانگر LTR۱-UBC۸۰۸-۲ با صفات ارتفاع بوته و وزن صد دانه و نشانگر LTR۱-UBC۸۰۷-۴ با صفات وزن ساقه اصلی و تعداد کپسول ساقه اصلی می تواند ناشی از آثار پلیوتروپی و یا پیوستگی نواحی ژنومی دخیل در این صفات باشد. باوجوداین، نتایج این مطالعه می تواند با گنجاندن تعداد بیشتری از نشانگرهایی که با صفات مهم اقتصادی مرتبط هستند، تقویت شود.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

حسین عباسی هولاسو

دانشجوی فرادکتری، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران

فاطمه رحمانی

دانشیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران

مینا حسین زاده

دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران

عبدالله حسن زاده قورت تپه

استادیار، بخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان آذربایجان غربی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، ارومیه، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Asgarinia, P., Cliutier, S., Duguid, S., Rashid, Kh., Mirlohi, A.F., ...
  • Ausubel, F.M., Brent, R., Kingston, R.E., Moore, D.D., Seidman, J.G., ...
  • Bradbury, P.J., Zhang, Z., Kroon, D.E., Casstevens, T.M., Ramdoss, Y. ...
  • Breseghello, F. and Sorrells, M.E., ۲۰۰۶. Association mapping of kernel ...
  • Choudhary, Sh.B., Sharma, H.K., Kumar, A.A., Chowdhaury, I., Maruthi, R.T. ...
  • Cloutier, S., Ragupathy, R., Miranda, E., Radovanovic, N., Reimer, E., ...
  • Earl, D.A., Louie, K.D., Bardeleben, C., Swift, C.C. and Jacobs, ...
  • Evanno, G., Regnaut, S. and Goudet, J., ۲۰۰۵. Detecting the ...
  • Gupta, P.K., Rustgi, S. and Kulwal, P.L., ۲۰۰۵. Linkage disequilibrium ...
  • He, L., Xiao, J., Rashid, Kh.Y., Yao, Zh., Li, P., ...
  • Hedrick, P.W., ۱۹۸۷. Gametic disequilibrium measures: proceed with caution. Genetics, ...
  • Hegary, S., Geleta, M., Bryngelsson, T., Asanaliev, A., Garkava-Gustavsson, L., ...
  • Jia, G. and Booker, H.M., ۲۰۱۸. Optimal models in the ...
  • Mackay, I.J., Bansep-Basler, P., Barber, T., Bentley, A.R., Cockram, J., ...
  • Moose, S.P. and Mumm, R.H., ۲۰۰۸. Molecular plant breeding as ...
  • Pritchard, J.K., Stephanes, M., Rosenberg, N.A. and Donnelly, P., ۲۰۰۰. ...
  • Ragupathy, R., Rathinavelu, R. and Cloutier, S., ۲۰۱۱. Physical mapping ...
  • Rostok, N., Ramsay, L., MacKenzie, K., Cardle, L. and Bhat, ...
  • Russo, M.A., Ficco, D.B.M., Marone, D., De Vita, P., Vallega, ...
  • Sharma, H.K., Sarkar, M., Choudhary, S.B., Kumar, A.A., Maruthi, R.T., ...
  • Smykal, P., Bacova-Kerteszova, N., Kalendar, R., Corander, J., Schlman, A.H. ...
  • Soto-Cerda, B.J., Diederichsen, A., Ragupathy, R. and Cloutier, S., ۲۰۱۳. ...
  • Soto-Cerda, B.J., Diederichsen, A., Duguid, S., Booker, H., Rowland, G. ...
  • Soto-Cerda, B.J., Duguid, S., Booker, H., Rowland, G., Diederichsen, A. ...
  • Soto-Cerda, B.J., Duguid, S., Booker, H., Rowland, G., Diederichsen, A. ...
  • Xie, D., Dai, Zh., Yang, Z., Tang, Q., Sun, J., ...
  • Yan, J., Shan, T., Warburton, M., Buckler, E., Mcmullen, M. ...
  • You, F.M., Jia, G., Xiao, J., Duguid, S.D., Rashid, K.Y., ...
  • Yu, J., Pressoir, G., Briggs, W.H., Vroh, B.I., Yamasaki, M. ...
  • Zhang, Q., Wu, C., Ren, F., Li, Y. and Zhang, ...
  • Zhu, C.M., Gore, E., Buckler, S. and Yu, J., ۲۰۰۸. ...
  • نمایش کامل مراجع