بررسی چندشکلی تعدادی از نشانگرهای ریزماهواره (Microsatellite) در یک جمعیت از گوسفندان بلوچی

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 225

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_RAP-10-25_012

تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400

چکیده مقاله:

    نظر به اهمیت حفظ و نگهداری نژادهای بومی به عنوان ذخایر ژنتیکی کشور، نژاد گوسفند بلوچی به عنوان پرجمعیت ترین نژاد گوسفند ایرانی و داشتن شجره قابل اطمینان، انتخاب شد. در این تحقیق با استفاده از ۱۵ نشانگر ریزماهواره (TGLA۲۳۱, OarVH۱۱۰, McMA۱۰, McMA۱, McM۲۱۴, McM۱۳۹ McM۶۳, LSCV۳۸, LSCV۳۶, KD۱۰۱, BMS۲۷۲۱, BMS۹۹۵, BMS۳۳۲, BM۱۸۱۵, BM۷۳۷ ( تنوع ژنتیکی در یک جمعیت از گوسفند بلوچی مورد بررسی قرار گرفت. تعداد ۱۴۰ راس دام از ایستگاه عباس آباد مشهد به صورت تصادفی انتخاب شدند. پس از انجام واکنش های PCR، جایگاه McM۱۳۹  به هیچ کدام از شرایط بهینه سازی تکثیر جواب نداد. جایگاه LSCV۳۸ به علت داشتن آلل صفر زیاد و عدم وضوح آللی مورد استفاده قرار نگرفت. بقیه جایگاه ها در جمعیت مورد مطالعه چند­شکل بودند. تعداد آلل­های مشاهده شده از ۶ آلل در جایگاه های BM۷۳۷، BMS۳۳۲، McMA۱۰ تا ۱۲ آلل در جایگاه McM۶۳ و آلل موثر از ۵۱/۳ در جایگاه LSCV۳۶ تا ۶۶/۸ در جایگاه OarVH۱۱۰ متغیر بودند. بیشترین هتروزایگوسیتی مورد انتظار در جایگاه OarVH۱۱۰با ۱۲ آلل و به مقدار (۸۹۰/۰) و کمترین آن در جایگاه LSCV۳۶ (۷۱۸/۰) با ۷ آلل مشاهده شد. بیشترین محتوای اطلاعاتی چندشکلی (PIC) در جایگاه OarVH۱۱۰ (۸۷۳/۰) و کمترین مقدار این معیار در جایگاه LSCV۳۶ (۶۶۹/۰) بود. بیشترین و کمترین مقدار شاخص شانون به ترتیب برای جایگاه OarVH۱۱۰ (۲۱/۲) و LSCV۳۶ (۴۷/۱) برآورد شد. با توجه به نتایج، جایگاه های ریزماهواره مورداستفاده از چندشکلی بالایی در جمعیت گوسفند بلوچی برخوردار بودند و می توان از چندشکلی بالای آنها در مطالعات بعدی، به ویژه برای یافتن جایگاه های صفات کمی استفاده نمود. وجود آلل­ها و دامنه آللی جدید در این نژاد حاکی از تفاوت ساختار جمعیتی آنها در مقایسه با گوسفندان نژاد های خارجی است. 

نویسندگان

عبدالرضا دانشور آملی

Human and Animal Cell Bank, Iranian Biological Resource Center (IBRC), Academic Center for Education, Culture and Research (ACECR), Tehran, Iran

سعید اسماعیل خانیان

Department of Animal Science Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran

محمدرضا سنجابی

Department of Animal, Poultry & Aquatic Sciences, Iranian Research Organization for Science and Technology, Tehran, Iran

سید احمد میرهادی

Department of Animal, Poultry & Aquatic Sciences, Iranian Research Organization for Science and Technology, Tehran, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ruane, J. ۱۹۹۹. A critical review of the value of ...
  • Amanlo, H. ۲۰۰۰. Genetic and Animal Breeding. Iran: Zanjan University ...
  • Dodgson, J.B., H.H. Cheng and R. Okimoto. ۱۹۹۷. DNA marker ...
  • Schlötterer, C. ۲۰۰۰. Evolutionary dynamics of microsatellite DNA. Chromosoma, ۱۰۹(۶): ...
  • Amoli, A.D., M. Aminafshar, S.A.S. Fazeli, N.E.J. Kashan and K.J. ...
  • Arranz, J., Y. Bayon and F. San Primitivo. ۲۰۰۱. Genetic ...
  • Tomasco, I., G. Wlasiuk and E. Lessa. ۲۰۰۲. Evaluation of ...
  • Banabazi, M.H., S. Esmaeilkhanian, S.M. Ashtiani and M.M. Shahrbabak. ۲۰۰۷. ...
  • Dashab, G.R., A. Aslaminejad, M.R. Nasirri, A. Esmailizadeh and D.A. ...
  • Gholizadeh, M. and M. Najafi. ۲۰۱۷. Association of genetic variation ...
  • Hosseinzadeh, S. and S.A. Rafat. ۲۰۱۷. Investigation of Relationship between ...
  • Miller, S., D. Dykes and H. Polesky. ۱۹۸۸. A simple ...
  • Hulme, D., A. Smith, J. Silk, J. Redwin and K. ...
  • Ott, J. ۱۹۸۹. Program HET Version ۱.۱۰. Utility programs for ...
  • Nei, M. ۱۹۷۸. Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...
  • Georges, M. and J.M. Massey. ۱۹۹۲. Polymorphic DNA markers in ...
  • Esmaeelkhanian, S. and R.V. Torshizi. ۲۰۰۷. Microsatellite variation in one ...
  • Nanekarani, S., C. Amirinia, N. Amirmozafari, R.V. Torshizi and A.A. ...
  • Bishop, M.D., S.M. Kappes, J.W. Keele, R.T. Stone, S. Sunden, ...
  • Stone, R., J. Pulido, G. Duyk, S. Kappes, J. Keele ...
  • Poissant, J., A. Shafer, C. Davis, J. Mainguy, J. Hogg, ...
  • Maddox, J., C. Riffkin and K. Beh. ۲۰۰۰. Dinucleotide repeat ...
  • Davies, K. and J. Maddox. ۱۹۹۷. Genetic linkage mapping of ...
  • Al-Atiyat, R.M. ۲۰۱۵. The power of ۲۸ microsatellite markers for ...
  • Paredes, M., A. Membrillo, J. Gutiérrez, I. Cervantes, P. Azor, ...
  • Ruane, J. ۱۹۹۹. A critical review of the value of ...
  • Amanlo, H. ۲۰۰۰. Genetic and Animal Breeding. Iran: Zanjan University ...
  • Dodgson, J.B., H.H. Cheng and R. Okimoto. ۱۹۹۷. DNA marker ...
  • Schlötterer, C. ۲۰۰۰. Evolutionary dynamics of microsatellite DNA. Chromosoma, ۱۰۹(۶): ...
  • Amoli, A.D., M. Aminafshar, S.A.S. Fazeli, N.E.J. Kashan and K.J. ...
  • Arranz, J., Y. Bayon and F. San Primitivo. ۲۰۰۱. Genetic ...
  • Tomasco, I., G. Wlasiuk and E. Lessa. ۲۰۰۲. Evaluation of ...
  • Banabazi, M.H., S. Esmaeilkhanian, S.M. Ashtiani and M.M. Shahrbabak. ۲۰۰۷. ...
  • Dashab, G.R., A. Aslaminejad, M.R. Nasirri, A. Esmailizadeh and D.A. ...
  • Gholizadeh, M. and M. Najafi. ۲۰۱۷. Association of genetic variation ...
  • Hosseinzadeh, S. and S.A. Rafat. ۲۰۱۷. Investigation of Relationship between ...
  • Miller, S., D. Dykes and H. Polesky. ۱۹۸۸. A simple ...
  • Hulme, D., A. Smith, J. Silk, J. Redwin and K. ...
  • Ott, J. ۱۹۸۹. Program HET Version ۱.۱۰. Utility programs for ...
  • Nei, M. ۱۹۷۸. Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...
  • Georges, M. and J.M. Massey. ۱۹۹۲. Polymorphic DNA markers in ...
  • Esmaeelkhanian, S. and R.V. Torshizi. ۲۰۰۷. Microsatellite variation in one ...
  • Nanekarani, S., C. Amirinia, N. Amirmozafari, R.V. Torshizi and A.A. ...
  • Bishop, M.D., S.M. Kappes, J.W. Keele, R.T. Stone, S. Sunden, ...
  • Stone, R., J. Pulido, G. Duyk, S. Kappes, J. Keele ...
  • Poissant, J., A. Shafer, C. Davis, J. Mainguy, J. Hogg, ...
  • Maddox, J., C. Riffkin and K. Beh. ۲۰۰۰. Dinucleotide repeat ...
  • Davies, K. and J. Maddox. ۱۹۹۷. Genetic linkage mapping of ...
  • Al-Atiyat, R.M. ۲۰۱۵. The power of ۲۸ microsatellite markers for ...
  • Paredes, M., A. Membrillo, J. Gutiérrez, I. Cervantes, P. Azor, ...
  • نمایش کامل مراجع