بهینه سازی شرایط PCR برای آنالیز SCoT در Halocnemum strobilaceum L.

در این تحقیق شرایط بهینه فرایند واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) برای ۱۲ آغازگر SCoT در گیاه Halocnemum strobilaceum L. مورد بررسی قرار گرفت. پنج پارامتر زمان و دمای بهینه اتصال آغازگر به رشته الگو و طویل شدن آن، تعداد چرخه های حرارتی واکنش، غلظت DNA الگو، ولتاژ و زمان بهینه الکتروفورز ارزیابی شد. نتایج نشان داد که شرایط بهینه واکنش SCoT-PCR با مقدار DNA ۶۰ng در ۲۰ میکرولیتر حجم کلی شامل واسرشت سازی اولیه، ۴ دقیقه در ۹۴°C؛ واسرشت سازی، ۱ دقیقه در ۹۴°C؛ اتصال آغازگر (۴۸a۵۴/۵) به مدت ۵۰ ثانیه؛ طویل شدن آغازگر، ۱/۵ دقیقه، ۳۰-۳۹ چرخه حرارتی و توسعه نهایی طی ۱۰ دقیقه در ۷۲°C میباشد. همچنین شرایط بهینه الکتروفورز بر روی ژل آگارز ۱,۵ درصد به مدت زمان یک ساعت و ولتاژ ۹۸ تعیین شد.

کلیدواژه ها:

تنوع ژنتیکی ، نشانگر مولکولی ، شاخصهای بهینه