شناسایی اعضای خانواده ژنی CBL در گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (Aeluropus littoralis)

تعیین توالی کامل ژنوم (WGS) گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (Aeluropus littoralis)، منابع ژنومیکی با ارزشی را جهت بررسی خصوصیات خانواده های ژنی درگیر در تنشهای مختلف غیرزیستی نظیر تنش شوری و خشکی فراهم نموده است. پروتئینهای شبه کالسینئورین (CBLs) B بعنوان یک مولکول پیام رسان ثانویه زیرخانواده گروه سنسورهای کلسیم بوده، که در تنظیم فرآیندهای فیزیولوژیکی و رشد و نمو گیاهان از نقشی کلیدی برخوردارند. در این تحقیق، بررسی سنسورهای کلسیم زیرخانواده CBL در دو گونه شورپسند آلوروپوس لیتورالیس و شیرینپسند آرابیدوپسیس تالیانا مورد بررسی قرار گرفت. بر اساس همولوژی توالی و روابط اورتولوژی با ژنهای آرابیدوپسیس، ۶ ژن شناسایی شده در ژنوم آلوروپوس در قالب سه گروه پروتئینی AlCBL۴، AlCBL۲ و AlCBL۱۰ دسته بندی شدند. بررسی خانواده ژنی AlCBL بر مبنای همردیفی چندگانه در گیاه آلوروپوس لیتورالیس موید حضور چهار دمین EF-hand در تمام این ژنها بوده که ساختاری را برای اتصال یون کلسیم فراهم مینماید. شباهت بالای خصوصیات فیزیکوشیمیایی اکثر پروتئینهای آلوروپوس به آرابیدوپسیس و داشتن رابطه قوی اورتولوژی با یکدیگر ممکن است دلالت بر محفوظ ماندن کارکرد و عملکرد این ژنها در فرایند تکاملی بوده باشد. پروفایل بیانی متفاوت در داده های بیانی RNA-seq آلوروپوس لیتورالیس، دلیلی بر الگوی عملکردی متفاوت این ژنها بود. نتایج بدست آمده در این تحقیق میتواند اطلاعات ارزشمندی در مورد نقش این خانواده ژنی و مکانیسمهای عملکردی آنها در تحمل به تنشهای غیر زیستی برای مطالعات آتی مهیا سازد.

کلیدواژه ها:

سنسور کلسیم ، هالوفیت ، تنش غیرزنده ، دمین EF-hand