ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری لکوز (BLV) در گاوهای هلشتاین ایران

محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 52، شماره: 1
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 412

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1253609

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-52-1_003

تاریخ نمایه سازی: 20 مرداد 1400

چکیده مقاله:

بیماری ویروس لکوز گاوی (BLV) یکی از بیماری های کشنده ویروسی است که هر ساله با ضررهای اقتصادی زیادی در صنعت گاو شیری، همانند کاهش توان تولیدی و عملکرد تولیدمثلی حیوانات مبتلا و درنهایت حذف آن ها همراه است. هدف از اجرای این پژوهش شناسایی نشانه­های انتخاب مرتبط با مقاومت به BLV در گاوهای هلشتاین ایران بود. به این منظور مجموع ۱۵۲ حیوان برای ۳۰۱۰۵ جایگاه نشانگریSNP با استفاده از تراشه­های GGP Bovine LD v۴ تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت داده­های اولیه در نهایت ۲۳۵۱۳ نشانگر SNP در ۱۴۰ راس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم (۶۸ راس) و بیمار (۷۷ راس) گروه­بندی شدند و بخش­هایی از ژنوم که در این حیوانات به صورت واگرا هدف انتخاب قرار گرفته بودند با استفاده از آماره نااریب تتا مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج این تحقیق نشان داد که چهار منطقه ژنومی روی کروموزوم­های شماره ۱، ۱۳، ۲۰ و ۲۲ در این حیوانات هدف انتخاب قرار گرفته­اند. بررسی ژن های گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این مناطق ژنومی، ژن هایی همانند ژن STGA۱ در کروموزوم ۱، ژن های STK۳۵، EBF۴ و PDYN در کروموزوم ۱۳ و ژن هایی SLC۳۸A۳، RASSF۱ و RBM۶ در کروموزوم ۲۲ شناسایی شده است. بررسی عملکرد این ژن ها نشان داد که این ژن ها در سیستم ایمنی و تنظیم چرخه میتوز و میوز و سرکوب سرطان نقش دارند. در مجموع نتایج این تحقیق می­تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در جهت شناسایی مناطق ژنومی کاندیدا و یا ژن های سببی مرتبط با این بیماری فراهم آورد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مهدی جوان نیکخواه

دانشجوی دکتری تخصصی ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، پردیس ارس، دانشگاه تهران، جلفا، ایران

حسین مرادی شهربابک

استادیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

محمد حسین مرادی

دانشیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی،دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک، اراک، ایران

علی صادقی سفیدمزگی

دانشیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی،دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abbasi Moshaii, B., Rahimi-Mianji, G., Nejai-Javaremi, A., Moradi, M. h. ...
  • Akey, J. M., Zhang, G., Zhang, K., Jin, L. & ...
  • Ballingall, K. T., Luyai, A., Rowlands, G. J., Sales, J., ...
  • Barendse, W., Harrison, B. E., Bunch, R. J., Thomas, M. ...
  • Bermingham, M., Bishop, S., Woolliams, J., Pong-Wong, R., Allen, A., ...
  • Bicalho, R., Galvão, K., Cheong, S., Gilbert, R., Warnick, L. ...
  • Biswas, S. & Akey, J. M. (۲۰۰۶). Genomic insights into ...
  • Brym, P., Bojarojć-Nosowicz, B., Oleński, K., Hering, D., Ruść, A., ...
  • Capra, M., Nuciforo, P.G., Confalonieri, S., Quarto, M., Bianchi, M., ...
  • Carramolino, L., Lee, B.C., Zaballos, A., Peled, A., Barthelemy, I., ...
  • Curi, R., Lagranha, C.J., Doi, S.Q., Sellitti, D.F., Procópio, J., ...
  • Curi, R., Newsholme, P., Procopio, J., Lagranha, C., Gorjão, R., ...
  • D'angelino, J., Garcia, M. & Birgel, E. (۱۹۹۸). Epidemiological study ...
  • Demasius, W., Weikard, R., Hadlich, F., Müller, K. E. & ...
  • Dong, Y., Xie, M., Jiang, Y., Xiao, N., Du, X., ...
  • Forough Ameri, N., Asadi Foozi, M. & Esmailizadeh Koshkoiyeh, A. ...
  • Gottschau, A., Willeberg, P., Franti, C. & Flensburg, J. (۱۹۹۰). ...
  • Goyal, P., Behring, A., Kumar, A. & Siess, W. (۲۰۱۱). ...
  • Grupp, K., Wilking, J., Prien, K., Hube-Magg, C., Sirma, H., ...
  • Guacci, V., Koshland, D. & Strunnikov, A. (۱۹۹۷). A direct ...
  • Gutiérrez, G., Carignano, H., Alvarez, I., Martínez, C., Porta, N., ...
  • Haeussinger, D. & Schliess, F. (۲۰۰۷). Glutamine metabolism and signaling ...
  • Hayes, B.J., Chamberlain, A.J., Maceachern, S., Savin, K., McPartlan, H., ...
  • Howard, J. L. (۱۹۹۳). Current veterinary therapy ۳: Food Animal ...
  • Huxley, J. & Whay, H. (۲۰۰۶). Current attitudes of cattle ...
  • Jacobsen, K., Kaneene, J., Miller, J. & Bull, R. (۱۹۸۵). ...
  • Kazemimanesh, M., Madadgr, O., Mahzoonieh, M., Zahraei, S. T. & ...
  • Khatami, F., Larijani, B., Heshmat, R., Keshtkar, A., Mohammadamoli, M., ...
  • Kreitman, M. (۲۰۰۰). Methods to detect selection in populations with ...
  • LaDronka, R. M., Ainsworth, S., Wilkins, M. J., Norby, B., ...
  • Lamore, S.D., Ahlberg, E., Boyer, S., Lamb, M.L., Hortigon-Vinagre, M.P., ...
  • Lewin, H. A., Russell, G. C. & Glass, E. J. ...
  • MacEachern, S., Hayes, B., McEwan, J. & Goddard, M. (۲۰۰۹). ...
  • Mancini, G., Gargani, M., Chillemi, G., Nicolazzi, E. L., Marsan, ...
  • McKenna, M.C. (۲۰۰۷). The glutamate‐glutamine cycle is not stoichiometric: Fates ...
  • Mee, J., Berry, D. & Cromie, A. (۲۰۱۱). Risk factors ...
  • Minozzi, G., Williams, J.L., Stella, A., Strozzi, F., Luini, M., ...
  • Miyasaka, T., Takeshima, S.N., Jimba, M., Matsumoto, Y., Kobayashi, N., ...
  • Mohammadi, V., Atyabi, N. & Nikbakht, B. (۲۰۱۱). Seroprevalence of ...
  • Moradi, M., Phua, S., Hedayat, N., Khodaei, M. M. & ...
  • Moradi, M. H., Nejati-Javaremi, A., Moradi-Shahrbabak, M., Dodds, K. G. ...
  • Mousavi, S., Haghparast, A., Mohammadi, G. & Tabatabaeizadeh, S.-E. (۲۰۱۴). ...
  • Murphy, F. A., Gibbs, E. P. J., Horzinek, M. C. ...
  • Nekoei, S., Taktaz Hafshejani, T., Doosti, A. & Khamesipour, F. ...
  • Nielsen, R. (۲۰۰۵). Molecular signatures of natural selection. Annual Reviwe ...
  • Nurjhan, N., Bucci, A., Perriello, G., Stumvoll, M., Dailey, G., ...
  • Ponomaryova, A.A., Rykova, E.Y., Cherdyntseva, N.V., Skvortsova, T.E., Dobrodeev, A.Y., ...
  • Prabhu, V.V. & Devaraj, N. (۲۰۱۷). Regulating RNA Binding Motif ...
  • Prudêncio, M., Rodrigues, C.D., Hannus, M., Martin, C., Real, E., ...
  • Qanbari, S., Gianola, D., Hayes, B., Schenkel, F., Miller, S., ...
  • Radostitis, E., Gay, C., Blood, D. & Hinchcliff, K. (۲۰۰۰). ...
  • Sakurai, T., Kashida, H., Komeda, Y., Nagai, T., Hagiwara, S., ...
  • Schoepf, K., Kapaga, A., Masami, H. & Hyera, J. (۱۹۹۷). ...
  • Sharif, S., Mallard, B., Wilkie, B., Sargeant, J., Scott, H., ...
  • Stephen, J.K., Chitale, D., Narra, V., Chen, K.M., Sawhney, R. ...
  • Stella, A., Ajmone-Marsan, P., Lazzari, B. & Boettcher, P. (۲۰۱۰). ...
  • Stumvoll, M., Perriello, G., Meyer, C. & Gerich, J. (۱۹۹۹). ...
  • Sumara, I., Vorlaufer, E., Gieffers, C., Peters, B. H. & ...
  • Teo, Y. Y., Fry, A. E., Clark, T. G., Tai, ...
  • Tizard, I. (۲۰۰۴). Acquired immunity: antigen-presenting receptors. Veterinary Immunology: an ...
  • Udina, I., Karamysheva, E., Turkova, S., Orlova, A. & Sulimova, ...
  • Urbinati, I., Stafuzza, N.B., Oliveira, M.T., Chud, T.C.S., Higa, R.H., ...
  • Vlahov, N., Scrace, S., Soto, M.S., Grawenda, A.M., Bradley, L., ...
  • Wang, S. S., Betz, A. G. & Reed, R. R. ...
  • Weir, B. S. & Cockerham, C. C. (۱۹۸۴). Estimating F‐statistics ...
  • Welbourne, T., Childress, D. & Givens, G. (۱۹۸۶). Renal regulation ...
  • Welbourne, T. C. & Matthews, J. C. (۱۹۹۹). Glutamate transport ...
  • Williams, J. G., Kubelik, A. R., Livak, K. J., Rafalski, ...
  • Wright, S. (۱۹۶۵). The interpretation of population structure by F-statistics ...
  • Wu, G. (۲۰۰۹). Amino acids: metabolism, functions, and nutrition. Amino ...
  • Yang, S., Li, X., Li, K., Fan, B. & Tang, ...
  • Yang, Z.-G., Ma, X.-D., He, Z.-H. & Guo, Y.-x. (۲۰۱۷). ...
  • Yasuda, Y., Miyamoto, Y., Yamashiro, T., Asally, M., Masui, A., ...
    • نمایش کامل مراجع