ارزیابی تنوع ژنتیکی پنج گونه جنس Fraxinus با نشانگرهای کلروپلاستی

شناسایی گونه های یک جنس از طریق مورفولوژی گیاه همواره با خطا همراه است. استفاده از نشانگرهای کلروپلاستی نقش مهمی در تمایز گونه ها دارد. بنابراین شناسایی گونه های مختلف جنس ون با استفاده از توالی های کلروپلاستی هدف گذاری شده است. توالی پنج گونه ون از داده پایگاه NCBI دانلود و پس از همردیفی چند گانه توالیها، تشکیل ماتریس فاصله انجام و ترسیم درخت فیلوژنتیکی با استفاده از کل توالی ژنومی و نواحی SSC LSC و IR با نرم افزار MEGA۷ صورت گرفت. درخت فیلوژنتیکی حاصل از آنالیز فیلوژنتیکی با روش های حداکثر درست نمایی و اتصال همسایه، سه کلاد کاملا مشخص را نشان داد که پنج گونه ون از همدیگر به طور واضح تمایز یافتند. نتایج نشان داد که کل طول ژنوم و ناحیه LSC و SSC توانایی لازم برای تمایز پنج گونه مختلف ون را دارند.

کلیدواژه ها:

آنالیز فیلوژنتیکی ، ون ، ژنوم کلروپلاستی ، MEGA۷