شناسایی ژن ها و نشانگرهای مولکولی مرتبط با مولفه های جوانه زنی در رگه های F۹ برنج تحت تنش اسمزی
محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 7، شماره: 1
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 262
فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_PGRLU-7-1_010
تاریخ نمایه سازی: 18 خرداد 1400
چکیده مقاله:
برنج نسبت به سایر غلات به آب بیشتری برای رشد و نمو نیاز دارد بنابراین تنش های آبی خسارت بیشتری به آن وارد می کند و لذا بهبود ارقام برنج برای تحمل به تنش های محیطی ضروری است. در این آزمایش ۱۵۴ رگه خویش آمیخته نوترکیب برنج نسل F۹ حاصل از تلاقی ارقام شاه پسند و IR۲۸ در سه شرایط (بدون تنش، تنش اسمزی ۳/۰- و ۶/۰- مگاپاسکال حاصل از پلی اتیلن گلیکول) به صورت آزمایش فاکتوریل در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی مورد بررسی قرار گرفتند. برای آزمایش مولکولی، چندشکلی ۱۱۰ نشانگر SSR و EST-SSR بین والدین جمعیت ارزیابی شدند و از بین آن ها، ۴۱ نشانگر چندشکل انتخاب شدند. تجزیه رگرسیون ارتباط بین مو لفه های جوانه زنی و نشانگرهای مولکولی نشان داد بیشترین ضریب تبیین در شرایط بدون تنش مربوط به نشانگر RM۲۱۱ برای ضریب آلومتریک (۱۷ درصد)، در ۳/۰- مگاپاسکال مربوط به RMES۱۰-۱ برای وزن خشک ساقه چه (۱۸ درصد) و در ۶/۰- مگاپاسکال مربوط به RM۲۷۳ برای یکنواختی جوانه زنی (۷/۲۲ درصد) بود. نشانگر های RM۳۴۹۶، RM۴۵۲ و RMES۶-۱ در این سه محیط، به ترتیب با شش، سه و هشت صفت، بیشترین تعداد ارتباط معنی دار با مولفه های جوانه زنی را نشان دادند و می توانند کاندید مناسبی جهت بهبود هم زمان چند صفت در برنامه های به نژادی انتخاب به کمک نشانگر باشند. همچنین پس از شناسایی نشانگر های معنی دار مرتبط با مولفه های جوانه زنی، نزدیک ترین ژن ها به این نشانگر ها به صورت بیوانفورماتیکی شناسایی و بیان آن ها با استفاده از پایگاه داده ترانسکریپتوم برنج بررسی شد. بر این اساس، بالاترین الگوی بیان تحت تنش خشکی مربوط به مکان ژنی LOC_Os۰۱g۵۷۲۲۰ و در شرایط بدون تنش مربوط به مکان ژنی LOC_Os۰۱g۲۶۰۳۹ شناسایی شد که می توان از این اطلاعات در برنامه های به نژادی استفاده کرد.
کلیدواژه ها:
Marker assisted selection ، Environmental stress ، Microsatellite markers ، انتخاب به کمک نشانگر ، تنش های محیطی ، نشانگرهای ریزماهواره
نویسندگان
عباس صابری کوچصفهانی
University of Guilan
عاطفه صبوری
Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan, Rasht, Iran
امین عابدی
Department of Biotechnology, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan, Rasht, Iran
علی اعلمی
Department of Biotechnology, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan, Rasht, Iran
تیمور رضوی پور
Rice Research Institute of Iran, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Rasht, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :